Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LSM12Q3MHD2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LSM12Q3MHD2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LSM12Q3MHD2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LSM12Q3MHD2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LSM12Q3MHD2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LSM12Q3MHD2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LSM12Q3MHD2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LSM12Q3MHD2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LSM12Q3MHD2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LSM12Q3MHD2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LSM12Q3MHD2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LSM12Q3MHD2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LSM12Q3MHD2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LSM12Q3MHD2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSM12Q3MHD2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSM12Q3MHD2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSM12Q3MHD2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSM12Q3MHD2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSM12Q3MHD2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LSM12Q3MHD2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LSM12Q3MHD2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LSM12Q3MHD2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LSM12Q3MHD2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LSM12Q3MHD2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LSM12Q3MHD2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LSM12Q3MHD2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LSM12Q3MHD2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LSM12Q3MHD2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LSM12Q3MHD2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LSM12Q3MHD2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LSM12Q3MHD2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LSM12Q3MHD2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LSM12Q3MHD2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LSM12Q3MHD2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LSM12Q3MHD2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LSM12Q3MHD2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LSM12Q3MHD2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LSM12Q3MHD2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LSM12Q3MHD2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LSM12Q3MHD2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LSM12Q3MHD2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LSM12Q3MHD2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LSM12Q3MHD2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LSM12Q3MHD2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LSM12Q3MHD2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LSM12Q3MHD2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LSM12Q3MHD2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LSM12Q3MHD2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LSM12Q3MHD2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LSM12Q3MHD2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LSM12Q3MHD2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LSM12Q3MHD2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LSM12Q3MHD2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LSM12Q3MHD2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LSM12Q3MHD2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LSM12Q3MHD2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LSM12Q3MHD2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LSM12Q3MHD2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LSM12Q3MHD2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LSM12Q3MHD2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LSM12Q3MHD2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LSM12Q3MHD2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LSM12Q3MHD2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LSM12Q3MHD2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LSM12Q3MHD2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LSM12Q3MHD2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LSM12Q3MHD2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LSM12Q3MHD2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LSM12Q3MHD2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LSM12Q3MHD2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LSM12Q3MHD2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LSM12Q3MHD2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LSM12Q3MHD2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LSM12Q3MHD2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LSM12Q3MHD2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LSM12Q3MHD2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LSM12Q3MHD2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LSM12Q3MHD2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LSM12Q3MHD2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LSM12Q3MHD2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LSM12Q3MHD2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LSM12Q3MHD2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LSM12Q3MHD2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LSM12Q3MHD2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LSM12Q3MHD2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LSM12Q3MHD2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LSM12Q3MHD2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LSM12Q3MHD2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LSM12Q3MHD2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LSM12Q3MHD2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LSM12Q3MHD2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LSM12Q3MHD2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LSM12Q3MHD2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LSM12Q3MHD2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LSM12Q3MHD2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LSM12Q3MHD2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LSM12Q3MHD2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LSM12Q3MHD2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LSM12Q3MHD2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms