Protein–RNA interactions for Protein: Q32NB8

PGS1, CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGS1Q32NB8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PGS1Q32NB8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGS1Q32NB8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGS1Q32NB8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGS1Q32NB8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGS1Q32NB8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGS1Q32NB8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGS1Q32NB8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGS1Q32NB8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGS1Q32NB8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGS1Q32NB8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGS1Q32NB8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGS1Q32NB8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGS1Q32NB8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGS1Q32NB8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PGS1Q32NB8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PGS1Q32NB8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PGS1Q32NB8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PGS1Q32NB8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PGS1Q32NB8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGS1Q32NB8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGS1Q32NB8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PGS1Q32NB8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGS1Q32NB8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGS1Q32NB8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGS1Q32NB8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGS1Q32NB8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGS1Q32NB8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGS1Q32NB8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGS1Q32NB8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PGS1Q32NB8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGS1Q32NB8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PGS1Q32NB8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGS1Q32NB8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGS1Q32NB8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGS1Q32NB8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PGS1Q32NB8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGS1Q32NB8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGS1Q32NB8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGS1Q32NB8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGS1Q32NB8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGS1Q32NB8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PGS1Q32NB8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGS1Q32NB8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGS1Q32NB8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PGS1Q32NB8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PGS1Q32NB8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGS1Q32NB8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGS1Q32NB8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGS1Q32NB8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGS1Q32NB8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGS1Q32NB8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGS1Q32NB8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGS1Q32NB8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGS1Q32NB8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGS1Q32NB8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGS1Q32NB8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGS1Q32NB8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGS1Q32NB8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGS1Q32NB8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGS1Q32NB8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGS1Q32NB8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGS1Q32NB8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PGS1Q32NB8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGS1Q32NB8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGS1Q32NB8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGS1Q32NB8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGS1Q32NB8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGS1Q32NB8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PGS1Q32NB8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PGS1Q32NB8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PGS1Q32NB8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PGS1Q32NB8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PGS1Q32NB8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PGS1Q32NB8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PGS1Q32NB8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PGS1Q32NB8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PGS1Q32NB8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PGS1Q32NB8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PGS1Q32NB8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PGS1Q32NB8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PGS1Q32NB8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PGS1Q32NB8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PGS1Q32NB8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PGS1Q32NB8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PGS1Q32NB8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PGS1Q32NB8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGS1Q32NB8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGS1Q32NB8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGS1Q32NB8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGS1Q32NB8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PGS1Q32NB8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PGS1Q32NB8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGS1Q32NB8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGS1Q32NB8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGS1Q32NB8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGS1Q32NB8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGS1Q32NB8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PGS1Q32NB8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGS1Q32NB8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms