Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
COL24A1Q17RW2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
COL24A1Q17RW2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
COL24A1Q17RW2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
COL24A1Q17RW2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
COL24A1Q17RW2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
COL24A1Q17RW2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
COL24A1Q17RW2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
COL24A1Q17RW2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
COL24A1Q17RW2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
COL24A1Q17RW2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
COL24A1Q17RW2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
COL24A1Q17RW2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
COL24A1Q17RW2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
COL24A1Q17RW2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
COL24A1Q17RW2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
COL24A1Q17RW2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
COL24A1Q17RW2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
COL24A1Q17RW2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
COL24A1Q17RW2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
COL24A1Q17RW2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
COL24A1Q17RW2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
COL24A1Q17RW2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
COL24A1Q17RW2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
COL24A1Q17RW2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
COL24A1Q17RW2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
COL24A1Q17RW2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
COL24A1Q17RW2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
COL24A1Q17RW2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
COL24A1Q17RW2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
COL24A1Q17RW2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
COL24A1Q17RW2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
COL24A1Q17RW2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
COL24A1Q17RW2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
COL24A1Q17RW2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
COL24A1Q17RW2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
COL24A1Q17RW2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
COL24A1Q17RW2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
COL24A1Q17RW2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
COL24A1Q17RW2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
COL24A1Q17RW2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
COL24A1Q17RW2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
COL24A1Q17RW2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
COL24A1Q17RW2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
COL24A1Q17RW2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
COL24A1Q17RW2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
COL24A1Q17RW2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
COL24A1Q17RW2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
COL24A1Q17RW2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
COL24A1Q17RW2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
COL24A1Q17RW2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
COL24A1Q17RW2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
COL24A1Q17RW2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
COL24A1Q17RW2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
COL24A1Q17RW2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
COL24A1Q17RW2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
COL24A1Q17RW2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
COL24A1Q17RW2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
COL24A1Q17RW2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
COL24A1Q17RW2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
COL24A1Q17RW2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
COL24A1Q17RW2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
COL24A1Q17RW2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
COL24A1Q17RW2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
COL24A1Q17RW2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
COL24A1Q17RW2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
COL24A1Q17RW2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
COL24A1Q17RW2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
COL24A1Q17RW2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
COL24A1Q17RW2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
COL24A1Q17RW2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
COL24A1Q17RW2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
COL24A1Q17RW2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
COL24A1Q17RW2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
COL24A1Q17RW2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
COL24A1Q17RW2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
COL24A1Q17RW2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
COL24A1Q17RW2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
COL24A1Q17RW2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
COL24A1Q17RW2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
COL24A1Q17RW2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
COL24A1Q17RW2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
COL24A1Q17RW2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
COL24A1Q17RW2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
COL24A1Q17RW2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
COL24A1Q17RW2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
COL24A1Q17RW2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
COL24A1Q17RW2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
COL24A1Q17RW2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
COL24A1Q17RW2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
COL24A1Q17RW2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
COL24A1Q17RW2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
COL24A1Q17RW2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
COL24A1Q17RW2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
COL24A1Q17RW2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
COL24A1Q17RW2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
COL24A1Q17RW2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
COL24A1Q17RW2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.09■■■■□ 3.05
COL24A1Q17RW2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
COL24A1Q17RW2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms