Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLPPQ16740 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLPPQ16740 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CLPPQ16740 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLPPQ16740 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLPPQ16740 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLPPQ16740 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLPPQ16740 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLPPQ16740 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLPPQ16740 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLPPQ16740 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLPPQ16740 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLPPQ16740 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLPPQ16740 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLPPQ16740 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLPPQ16740 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLPPQ16740 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CLPPQ16740 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLPPQ16740 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLPPQ16740 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLPPQ16740 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLPPQ16740 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLPPQ16740 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLPPQ16740 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLPPQ16740 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLPPQ16740 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLPPQ16740 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLPPQ16740 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLPPQ16740 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLPPQ16740 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLPPQ16740 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLPPQ16740 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CLPPQ16740 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLPPQ16740 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLPPQ16740 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLPPQ16740 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLPPQ16740 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLPPQ16740 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLPPQ16740 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLPPQ16740 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLPPQ16740 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CLPPQ16740 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLPPQ16740 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLPPQ16740 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLPPQ16740 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLPPQ16740 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLPPQ16740 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLPPQ16740 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLPPQ16740 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLPPQ16740 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CLPPQ16740 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLPPQ16740 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLPPQ16740 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLPPQ16740 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLPPQ16740 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLPPQ16740 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLPPQ16740 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLPPQ16740 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLPPQ16740 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLPPQ16740 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLPPQ16740 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLPPQ16740 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CLPPQ16740 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLPPQ16740 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLPPQ16740 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLPPQ16740 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLPPQ16740 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLPPQ16740 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLPPQ16740 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLPPQ16740 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLPPQ16740 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLPPQ16740 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLPPQ16740 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLPPQ16740 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLPPQ16740 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLPPQ16740 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLPPQ16740 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLPPQ16740 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLPPQ16740 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLPPQ16740 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CLPPQ16740 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLPPQ16740 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLPPQ16740 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLPPQ16740 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLPPQ16740 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLPPQ16740 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLPPQ16740 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLPPQ16740 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLPPQ16740 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLPPQ16740 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLPPQ16740 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CLPPQ16740 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLPPQ16740 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLPPQ16740 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLPPQ16740 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLPPQ16740 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLPPQ16740 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLPPQ16740 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLPPQ16740 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLPPQ16740 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
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