Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
STX1AQ16623 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
STX1AQ16623 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
STX1AQ16623 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
STX1AQ16623 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
STX1AQ16623 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
STX1AQ16623 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
STX1AQ16623 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
STX1AQ16623 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
STX1AQ16623 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
STX1AQ16623 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
STX1AQ16623 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
STX1AQ16623 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
STX1AQ16623 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
STX1AQ16623 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
STX1AQ16623 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
STX1AQ16623 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
STX1AQ16623 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
STX1AQ16623 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
STX1AQ16623 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
STX1AQ16623 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
STX1AQ16623 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
STX1AQ16623 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
STX1AQ16623 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
STX1AQ16623 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
STX1AQ16623 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
STX1AQ16623 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
STX1AQ16623 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
STX1AQ16623 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
STX1AQ16623 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
STX1AQ16623 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
STX1AQ16623 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
STX1AQ16623 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
STX1AQ16623 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
STX1AQ16623 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
STX1AQ16623 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
STX1AQ16623 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
STX1AQ16623 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
STX1AQ16623 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
STX1AQ16623 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
STX1AQ16623 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
STX1AQ16623 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
STX1AQ16623 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
STX1AQ16623 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
STX1AQ16623 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
STX1AQ16623 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
STX1AQ16623 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
STX1AQ16623 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
STX1AQ16623 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
STX1AQ16623 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
STX1AQ16623 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
STX1AQ16623 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
STX1AQ16623 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
STX1AQ16623 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
STX1AQ16623 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
STX1AQ16623 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
STX1AQ16623 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
STX1AQ16623 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
STX1AQ16623 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
STX1AQ16623 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
STX1AQ16623 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
STX1AQ16623 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
STX1AQ16623 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
STX1AQ16623 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
STX1AQ16623 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
STX1AQ16623 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
STX1AQ16623 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
STX1AQ16623 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
STX1AQ16623 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
STX1AQ16623 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
STX1AQ16623 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
STX1AQ16623 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
STX1AQ16623 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
STX1AQ16623 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
STX1AQ16623 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
STX1AQ16623 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
STX1AQ16623 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
STX1AQ16623 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
STX1AQ16623 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
STX1AQ16623 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
STX1AQ16623 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
STX1AQ16623 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
STX1AQ16623 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
STX1AQ16623 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
STX1AQ16623 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
STX1AQ16623 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
STX1AQ16623 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
STX1AQ16623 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
STX1AQ16623 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
STX1AQ16623 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
STX1AQ16623 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
STX1AQ16623 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
STX1AQ16623 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
STX1AQ16623 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
STX1AQ16623 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
STX1AQ16623 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
STX1AQ16623 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
STX1AQ16623 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
STX1AQ16623 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
STX1AQ16623 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms