Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF13Q15543 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF13Q15543 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF13Q15543 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF13Q15543 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF13Q15543 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF13Q15543 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF13Q15543 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF13Q15543 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF13Q15543 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF13Q15543 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF13Q15543 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF13Q15543 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TAF13Q15543 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF13Q15543 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF13Q15543 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF13Q15543 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF13Q15543 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF13Q15543 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TAF13Q15543 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF13Q15543 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF13Q15543 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF13Q15543 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF13Q15543 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF13Q15543 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF13Q15543 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF13Q15543 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF13Q15543 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF13Q15543 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF13Q15543 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF13Q15543 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF13Q15543 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF13Q15543 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF13Q15543 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF13Q15543 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF13Q15543 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF13Q15543 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF13Q15543 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF13Q15543 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF13Q15543 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF13Q15543 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF13Q15543 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF13Q15543 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF13Q15543 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF13Q15543 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF13Q15543 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF13Q15543 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF13Q15543 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF13Q15543 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF13Q15543 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF13Q15543 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF13Q15543 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF13Q15543 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF13Q15543 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF13Q15543 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF13Q15543 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF13Q15543 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF13Q15543 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF13Q15543 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF13Q15543 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF13Q15543 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF13Q15543 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF13Q15543 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TAF13Q15543 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF13Q15543 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF13Q15543 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF13Q15543 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF13Q15543 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF13Q15543 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF13Q15543 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF13Q15543 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF13Q15543 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAF13Q15543 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAF13Q15543 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAF13Q15543 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF13Q15543 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF13Q15543 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF13Q15543 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF13Q15543 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF13Q15543 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF13Q15543 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF13Q15543 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF13Q15543 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF13Q15543 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF13Q15543 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF13Q15543 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF13Q15543 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF13Q15543 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF13Q15543 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF13Q15543 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF13Q15543 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF13Q15543 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF13Q15543 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF13Q15543 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF13Q15543 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF13Q15543 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF13Q15543 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TAF13Q15543 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TAF13Q15543 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF13Q15543 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
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