Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SIX1Q15475 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIX1Q15475 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIX1Q15475 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIX1Q15475 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIX1Q15475 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIX1Q15475 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIX1Q15475 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIX1Q15475 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIX1Q15475 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIX1Q15475 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIX1Q15475 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SIX1Q15475 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIX1Q15475 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIX1Q15475 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIX1Q15475 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIX1Q15475 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIX1Q15475 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIX1Q15475 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIX1Q15475 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIX1Q15475 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIX1Q15475 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIX1Q15475 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIX1Q15475 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIX1Q15475 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIX1Q15475 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIX1Q15475 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIX1Q15475 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIX1Q15475 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIX1Q15475 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIX1Q15475 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SIX1Q15475 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SIX1Q15475 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SIX1Q15475 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SIX1Q15475 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SIX1Q15475 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SIX1Q15475 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SIX1Q15475 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIX1Q15475 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SIX1Q15475 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SIX1Q15475 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SIX1Q15475 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SIX1Q15475 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SIX1Q15475 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SIX1Q15475 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SIX1Q15475 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIX1Q15475 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIX1Q15475 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SIX1Q15475 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIX1Q15475 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIX1Q15475 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIX1Q15475 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIX1Q15475 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIX1Q15475 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIX1Q15475 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIX1Q15475 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIX1Q15475 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIX1Q15475 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SIX1Q15475 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SIX1Q15475 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SIX1Q15475 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SIX1Q15475 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SIX1Q15475 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SIX1Q15475 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIX1Q15475 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SIX1Q15475 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIX1Q15475 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SIX1Q15475 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIX1Q15475 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SIX1Q15475 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIX1Q15475 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIX1Q15475 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIX1Q15475 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SIX1Q15475 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SIX1Q15475 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIX1Q15475 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIX1Q15475 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIX1Q15475 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIX1Q15475 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SIX1Q15475 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SIX1Q15475 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIX1Q15475 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SIX1Q15475 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIX1Q15475 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIX1Q15475 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIX1Q15475 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIX1Q15475 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SIX1Q15475 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIX1Q15475 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIX1Q15475 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIX1Q15475 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SIX1Q15475 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SIX1Q15475 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIX1Q15475 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIX1Q15475 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIX1Q15475 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIX1Q15475 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SIX1Q15475 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SIX1Q15475 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SIX1Q15475 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
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