Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SF3A2Q15428 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3A2Q15428 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3A2Q15428 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3A2Q15428 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3A2Q15428 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3A2Q15428 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3A2Q15428 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3A2Q15428 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3A2Q15428 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SF3A2Q15428 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SF3A2Q15428 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SF3A2Q15428 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SF3A2Q15428 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SF3A2Q15428 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SF3A2Q15428 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SF3A2Q15428 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SF3A2Q15428 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3A2Q15428 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3A2Q15428 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3A2Q15428 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3A2Q15428 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SF3A2Q15428 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SF3A2Q15428 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SF3A2Q15428 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SF3A2Q15428 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SF3A2Q15428 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SF3A2Q15428 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SF3A2Q15428 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SF3A2Q15428 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SF3A2Q15428 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SF3A2Q15428 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SF3A2Q15428 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SF3A2Q15428 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SF3A2Q15428 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SF3A2Q15428 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SF3A2Q15428 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SF3A2Q15428 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SF3A2Q15428 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SF3A2Q15428 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SF3A2Q15428 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SF3A2Q15428 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SF3A2Q15428 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SF3A2Q15428 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SF3A2Q15428 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SF3A2Q15428 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SF3A2Q15428 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SF3A2Q15428 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SF3A2Q15428 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SF3A2Q15428 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SF3A2Q15428 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SF3A2Q15428 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SF3A2Q15428 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SF3A2Q15428 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SF3A2Q15428 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SF3A2Q15428 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SF3A2Q15428 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SF3A2Q15428 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SF3A2Q15428 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SF3A2Q15428 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SF3A2Q15428 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SF3A2Q15428 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SF3A2Q15428 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SF3A2Q15428 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SF3A2Q15428 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SF3A2Q15428 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SF3A2Q15428 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SF3A2Q15428 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SF3A2Q15428 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SF3A2Q15428 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SF3A2Q15428 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SF3A2Q15428 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SF3A2Q15428 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SF3A2Q15428 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SF3A2Q15428 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SF3A2Q15428 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SF3A2Q15428 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SF3A2Q15428 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SF3A2Q15428 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SF3A2Q15428 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SF3A2Q15428 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SF3A2Q15428 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SF3A2Q15428 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SF3A2Q15428 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SF3A2Q15428 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SF3A2Q15428 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SF3A2Q15428 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SF3A2Q15428 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF3A2Q15428 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF3A2Q15428 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF3A2Q15428 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF3A2Q15428 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF3A2Q15428 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF3A2Q15428 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SF3A2Q15428 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SF3A2Q15428 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SF3A2Q15428 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SF3A2Q15428 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SF3A2Q15428 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SF3A2Q15428 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms