Protein–RNA interactions for Protein: Q15291

RBBP5, Retinoblastoma-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP5Q15291 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBBP5Q15291 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RBBP5Q15291 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBBP5Q15291 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBBP5Q15291 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBBP5Q15291 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBBP5Q15291 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBBP5Q15291 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBBP5Q15291 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBBP5Q15291 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBBP5Q15291 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBBP5Q15291 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBBP5Q15291 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBBP5Q15291 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBBP5Q15291 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBBP5Q15291 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RBBP5Q15291 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RBBP5Q15291 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RBBP5Q15291 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBBP5Q15291 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBBP5Q15291 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBBP5Q15291 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBBP5Q15291 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBBP5Q15291 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RBBP5Q15291 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RBBP5Q15291 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RBBP5Q15291 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBBP5Q15291 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBBP5Q15291 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBBP5Q15291 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBBP5Q15291 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBBP5Q15291 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBBP5Q15291 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBBP5Q15291 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBBP5Q15291 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBBP5Q15291 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBBP5Q15291 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBBP5Q15291 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RBBP5Q15291 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RBBP5Q15291 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RBBP5Q15291 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RBBP5Q15291 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RBBP5Q15291 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RBBP5Q15291 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RBBP5Q15291 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBBP5Q15291 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBBP5Q15291 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBBP5Q15291 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBBP5Q15291 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBBP5Q15291 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBBP5Q15291 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBBP5Q15291 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBBP5Q15291 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBBP5Q15291 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBBP5Q15291 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBBP5Q15291 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBBP5Q15291 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBBP5Q15291 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBBP5Q15291 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBBP5Q15291 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBBP5Q15291 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RBBP5Q15291 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBBP5Q15291 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBBP5Q15291 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RBBP5Q15291 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBBP5Q15291 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBBP5Q15291 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBBP5Q15291 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBBP5Q15291 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RBBP5Q15291 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBBP5Q15291 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBBP5Q15291 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBBP5Q15291 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBBP5Q15291 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBBP5Q15291 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBBP5Q15291 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBBP5Q15291 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBBP5Q15291 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBBP5Q15291 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBBP5Q15291 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBBP5Q15291 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBBP5Q15291 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBBP5Q15291 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBBP5Q15291 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBBP5Q15291 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBBP5Q15291 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBBP5Q15291 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBBP5Q15291 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBBP5Q15291 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBBP5Q15291 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RBBP5Q15291 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBBP5Q15291 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBBP5Q15291 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBBP5Q15291 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBBP5Q15291 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBBP5Q15291 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBBP5Q15291 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBBP5Q15291 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RBBP5Q15291 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RBBP5Q15291 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms