Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ARHGEF6Q15052 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ARHGEF6Q15052 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ARHGEF6Q15052 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ARHGEF6Q15052 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
ARHGEF6Q15052 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ARHGEF6Q15052 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ARHGEF6Q15052 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ARHGEF6Q15052 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ARHGEF6Q15052 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ARHGEF6Q15052 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ARHGEF6Q15052 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ARHGEF6Q15052 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ARHGEF6Q15052 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ARHGEF6Q15052 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ARHGEF6Q15052 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ARHGEF6Q15052 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ARHGEF6Q15052 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ARHGEF6Q15052 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ARHGEF6Q15052 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ARHGEF6Q15052 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ARHGEF6Q15052 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARHGEF6Q15052 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARHGEF6Q15052 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARHGEF6Q15052 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARHGEF6Q15052 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARHGEF6Q15052 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ARHGEF6Q15052 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ARHGEF6Q15052 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARHGEF6Q15052 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARHGEF6Q15052 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARHGEF6Q15052 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARHGEF6Q15052 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARHGEF6Q15052 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARHGEF6Q15052 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ARHGEF6Q15052 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARHGEF6Q15052 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARHGEF6Q15052 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ARHGEF6Q15052 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ARHGEF6Q15052 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ARHGEF6Q15052 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ARHGEF6Q15052 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ARHGEF6Q15052 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ARHGEF6Q15052 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ARHGEF6Q15052 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ARHGEF6Q15052 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ARHGEF6Q15052 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ARHGEF6Q15052 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
ARHGEF6Q15052 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
ARHGEF6Q15052 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
ARHGEF6Q15052 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
ARHGEF6Q15052 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
ARHGEF6Q15052 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
ARHGEF6Q15052 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
ARHGEF6Q15052 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
ARHGEF6Q15052 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
ARHGEF6Q15052 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ARHGEF6Q15052 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ARHGEF6Q15052 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ARHGEF6Q15052 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
ARHGEF6Q15052 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ARHGEF6Q15052 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
ARHGEF6Q15052 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ARHGEF6Q15052 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ARHGEF6Q15052 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ARHGEF6Q15052 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ARHGEF6Q15052 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ARHGEF6Q15052 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ARHGEF6Q15052 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ARHGEF6Q15052 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ARHGEF6Q15052 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ARHGEF6Q15052 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
ARHGEF6Q15052 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ARHGEF6Q15052 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ARHGEF6Q15052 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ARHGEF6Q15052 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ARHGEF6Q15052 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ARHGEF6Q15052 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ARHGEF6Q15052 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ARHGEF6Q15052 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ARHGEF6Q15052 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ARHGEF6Q15052 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ARHGEF6Q15052 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ARHGEF6Q15052 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ARHGEF6Q15052 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ARHGEF6Q15052 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ARHGEF6Q15052 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ARHGEF6Q15052 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ARHGEF6Q15052 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ARHGEF6Q15052 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ARHGEF6Q15052 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ARHGEF6Q15052 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ARHGEF6Q15052 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ARHGEF6Q15052 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ARHGEF6Q15052 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ARHGEF6Q15052 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ARHGEF6Q15052 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ARHGEF6Q15052 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ARHGEF6Q15052 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ARHGEF6Q15052 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
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