Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KCNB1Q14721 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KCNB1Q14721 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KCNB1Q14721 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
KCNB1Q14721 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KCNB1Q14721 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KCNB1Q14721 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KCNB1Q14721 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KCNB1Q14721 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KCNB1Q14721 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KCNB1Q14721 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KCNB1Q14721 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KCNB1Q14721 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KCNB1Q14721 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KCNB1Q14721 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KCNB1Q14721 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KCNB1Q14721 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
KCNB1Q14721 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KCNB1Q14721 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KCNB1Q14721 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KCNB1Q14721 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KCNB1Q14721 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KCNB1Q14721 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KCNB1Q14721 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KCNB1Q14721 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KCNB1Q14721 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KCNB1Q14721 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KCNB1Q14721 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KCNB1Q14721 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KCNB1Q14721 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KCNB1Q14721 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KCNB1Q14721 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KCNB1Q14721 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KCNB1Q14721 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KCNB1Q14721 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KCNB1Q14721 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KCNB1Q14721 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KCNB1Q14721 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KCNB1Q14721 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KCNB1Q14721 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KCNB1Q14721 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KCNB1Q14721 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KCNB1Q14721 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
KCNB1Q14721 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
KCNB1Q14721 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KCNB1Q14721 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNB1Q14721 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNB1Q14721 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNB1Q14721 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KCNB1Q14721 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KCNB1Q14721 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KCNB1Q14721 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNB1Q14721 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNB1Q14721 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNB1Q14721 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KCNB1Q14721 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KCNB1Q14721 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KCNB1Q14721 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KCNB1Q14721 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNB1Q14721 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNB1Q14721 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNB1Q14721 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNB1Q14721 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KCNB1Q14721 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KCNB1Q14721 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KCNB1Q14721 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KCNB1Q14721 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KCNB1Q14721 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
KCNB1Q14721 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KCNB1Q14721 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KCNB1Q14721 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
KCNB1Q14721 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KCNB1Q14721 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCNB1Q14721 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCNB1Q14721 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCNB1Q14721 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCNB1Q14721 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KCNB1Q14721 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KCNB1Q14721 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KCNB1Q14721 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KCNB1Q14721 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
KCNB1Q14721 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KCNB1Q14721 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
KCNB1Q14721 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KCNB1Q14721 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KCNB1Q14721 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KCNB1Q14721 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KCNB1Q14721 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KCNB1Q14721 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KCNB1Q14721 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
KCNB1Q14721 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KCNB1Q14721 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KCNB1Q14721 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KCNB1Q14721 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KCNB1Q14721 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KCNB1Q14721 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KCNB1Q14721 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KCNB1Q14721 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KCNB1Q14721 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KCNB1Q14721 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms