Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EBI3Q14213 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EBI3Q14213 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EBI3Q14213 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EBI3Q14213 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EBI3Q14213 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBI3Q14213 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBI3Q14213 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBI3Q14213 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBI3Q14213 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBI3Q14213 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBI3Q14213 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBI3Q14213 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EBI3Q14213 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EBI3Q14213 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBI3Q14213 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBI3Q14213 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBI3Q14213 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBI3Q14213 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EBI3Q14213 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EBI3Q14213 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EBI3Q14213 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EBI3Q14213 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EBI3Q14213 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EBI3Q14213 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EBI3Q14213 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EBI3Q14213 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EBI3Q14213 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EBI3Q14213 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EBI3Q14213 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EBI3Q14213 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EBI3Q14213 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EBI3Q14213 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EBI3Q14213 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EBI3Q14213 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EBI3Q14213 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EBI3Q14213 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EBI3Q14213 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBI3Q14213 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBI3Q14213 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EBI3Q14213 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBI3Q14213 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBI3Q14213 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBI3Q14213 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBI3Q14213 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBI3Q14213 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EBI3Q14213 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EBI3Q14213 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EBI3Q14213 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EBI3Q14213 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EBI3Q14213 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EBI3Q14213 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EBI3Q14213 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EBI3Q14213 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EBI3Q14213 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EBI3Q14213 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EBI3Q14213 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EBI3Q14213 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EBI3Q14213 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EBI3Q14213 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EBI3Q14213 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EBI3Q14213 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EBI3Q14213 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EBI3Q14213 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EBI3Q14213 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EBI3Q14213 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EBI3Q14213 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EBI3Q14213 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EBI3Q14213 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EBI3Q14213 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EBI3Q14213 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EBI3Q14213 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EBI3Q14213 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EBI3Q14213 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EBI3Q14213 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EBI3Q14213 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
EBI3Q14213 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EBI3Q14213 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EBI3Q14213 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EBI3Q14213 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBI3Q14213 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBI3Q14213 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EBI3Q14213 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBI3Q14213 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBI3Q14213 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBI3Q14213 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBI3Q14213 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBI3Q14213 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBI3Q14213 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBI3Q14213 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EBI3Q14213 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EBI3Q14213 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EBI3Q14213 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EBI3Q14213 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EBI3Q14213 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EBI3Q14213 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EBI3Q14213 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EBI3Q14213 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EBI3Q14213 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EBI3Q14213 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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