Protein–RNA interactions for Protein: Q13621

SLC12A1, Solute carrier family 12 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A1Q13621 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC12A1Q13621 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC12A1Q13621 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC12A1Q13621 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC12A1Q13621 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC12A1Q13621 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC12A1Q13621 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC12A1Q13621 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC12A1Q13621 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC12A1Q13621 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC12A1Q13621 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC12A1Q13621 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC12A1Q13621 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC12A1Q13621 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC12A1Q13621 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC12A1Q13621 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC12A1Q13621 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC12A1Q13621 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC12A1Q13621 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC12A1Q13621 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC12A1Q13621 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC12A1Q13621 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC12A1Q13621 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC12A1Q13621 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC12A1Q13621 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC12A1Q13621 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC12A1Q13621 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC12A1Q13621 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC12A1Q13621 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC12A1Q13621 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC12A1Q13621 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC12A1Q13621 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC12A1Q13621 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC12A1Q13621 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC12A1Q13621 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC12A1Q13621 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC12A1Q13621 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC12A1Q13621 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC12A1Q13621 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC12A1Q13621 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC12A1Q13621 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC12A1Q13621 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC12A1Q13621 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC12A1Q13621 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC12A1Q13621 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC12A1Q13621 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC12A1Q13621 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC12A1Q13621 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC12A1Q13621 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC12A1Q13621 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC12A1Q13621 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC12A1Q13621 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC12A1Q13621 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC12A1Q13621 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC12A1Q13621 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SLC12A1Q13621 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC12A1Q13621 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC12A1Q13621 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC12A1Q13621 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC12A1Q13621 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC12A1Q13621 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC12A1Q13621 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC12A1Q13621 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC12A1Q13621 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC12A1Q13621 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC12A1Q13621 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC12A1Q13621 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC12A1Q13621 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC12A1Q13621 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC12A1Q13621 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC12A1Q13621 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC12A1Q13621 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC12A1Q13621 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC12A1Q13621 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC12A1Q13621 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC12A1Q13621 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC12A1Q13621 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC12A1Q13621 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC12A1Q13621 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC12A1Q13621 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC12A1Q13621 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC12A1Q13621 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC12A1Q13621 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC12A1Q13621 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC12A1Q13621 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC12A1Q13621 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC12A1Q13621 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC12A1Q13621 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC12A1Q13621 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC12A1Q13621 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC12A1Q13621 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC12A1Q13621 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC12A1Q13621 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC12A1Q13621 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC12A1Q13621 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC12A1Q13621 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC12A1Q13621 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC12A1Q13621 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC12A1Q13621 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC12A1Q13621 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms