Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RIPK1Q13546 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RIPK1Q13546 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RIPK1Q13546 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RIPK1Q13546 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RIPK1Q13546 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RIPK1Q13546 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIPK1Q13546 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIPK1Q13546 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIPK1Q13546 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIPK1Q13546 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RIPK1Q13546 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RIPK1Q13546 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RIPK1Q13546 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RIPK1Q13546 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIPK1Q13546 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIPK1Q13546 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIPK1Q13546 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIPK1Q13546 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIPK1Q13546 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIPK1Q13546 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIPK1Q13546 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIPK1Q13546 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIPK1Q13546 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIPK1Q13546 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIPK1Q13546 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RIPK1Q13546 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RIPK1Q13546 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIPK1Q13546 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIPK1Q13546 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIPK1Q13546 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIPK1Q13546 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIPK1Q13546 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIPK1Q13546 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIPK1Q13546 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIPK1Q13546 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIPK1Q13546 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIPK1Q13546 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIPK1Q13546 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIPK1Q13546 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIPK1Q13546 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIPK1Q13546 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIPK1Q13546 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIPK1Q13546 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPK1Q13546 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPK1Q13546 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPK1Q13546 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPK1Q13546 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPK1Q13546 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIPK1Q13546 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIPK1Q13546 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIPK1Q13546 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIPK1Q13546 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIPK1Q13546 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIPK1Q13546 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIPK1Q13546 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIPK1Q13546 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIPK1Q13546 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIPK1Q13546 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIPK1Q13546 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIPK1Q13546 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIPK1Q13546 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIPK1Q13546 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIPK1Q13546 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIPK1Q13546 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIPK1Q13546 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIPK1Q13546 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIPK1Q13546 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIPK1Q13546 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIPK1Q13546 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIPK1Q13546 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIPK1Q13546 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RIPK1Q13546 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIPK1Q13546 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIPK1Q13546 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIPK1Q13546 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIPK1Q13546 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIPK1Q13546 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIPK1Q13546 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RIPK1Q13546 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RIPK1Q13546 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RIPK1Q13546 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RIPK1Q13546 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RIPK1Q13546 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RIPK1Q13546 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIPK1Q13546 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIPK1Q13546 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIPK1Q13546 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIPK1Q13546 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIPK1Q13546 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIPK1Q13546 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIPK1Q13546 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RIPK1Q13546 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIPK1Q13546 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIPK1Q13546 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIPK1Q13546 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIPK1Q13546 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIPK1Q13546 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIPK1Q13546 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIPK1Q13546 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
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