Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KLF1Q13351 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KLF1Q13351 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KLF1Q13351 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KLF1Q13351 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
KLF1Q13351 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLF1Q13351 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLF1Q13351 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KLF1Q13351 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KLF1Q13351 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KLF1Q13351 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KLF1Q13351 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KLF1Q13351 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KLF1Q13351 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KLF1Q13351 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KLF1Q13351 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KLF1Q13351 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KLF1Q13351 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
KLF1Q13351 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KLF1Q13351 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KLF1Q13351 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KLF1Q13351 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KLF1Q13351 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KLF1Q13351 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KLF1Q13351 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KLF1Q13351 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KLF1Q13351 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KLF1Q13351 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KLF1Q13351 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KLF1Q13351 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KLF1Q13351 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KLF1Q13351 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KLF1Q13351 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KLF1Q13351 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KLF1Q13351 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KLF1Q13351 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KLF1Q13351 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
KLF1Q13351 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KLF1Q13351 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KLF1Q13351 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KLF1Q13351 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KLF1Q13351 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KLF1Q13351 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KLF1Q13351 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KLF1Q13351 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KLF1Q13351 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KLF1Q13351 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KLF1Q13351 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KLF1Q13351 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KLF1Q13351 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KLF1Q13351 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KLF1Q13351 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KLF1Q13351 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KLF1Q13351 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KLF1Q13351 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KLF1Q13351 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KLF1Q13351 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KLF1Q13351 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KLF1Q13351 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KLF1Q13351 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KLF1Q13351 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KLF1Q13351 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KLF1Q13351 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KLF1Q13351 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KLF1Q13351 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KLF1Q13351 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KLF1Q13351 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KLF1Q13351 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KLF1Q13351 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KLF1Q13351 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KLF1Q13351 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KLF1Q13351 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KLF1Q13351 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KLF1Q13351 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KLF1Q13351 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KLF1Q13351 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KLF1Q13351 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KLF1Q13351 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KLF1Q13351 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KLF1Q13351 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KLF1Q13351 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KLF1Q13351 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
KLF1Q13351 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KLF1Q13351 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KLF1Q13351 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KLF1Q13351 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
KLF1Q13351 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KLF1Q13351 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KLF1Q13351 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KLF1Q13351 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLF1Q13351 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLF1Q13351 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KLF1Q13351 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KLF1Q13351 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KLF1Q13351 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
KLF1Q13351 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KLF1Q13351 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
KLF1Q13351 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
KLF1Q13351 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KLF1Q13351 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
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