Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TRIM28Q13263 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
TRIM28Q13263 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
TRIM28Q13263 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
TRIM28Q13263 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
TRIM28Q13263 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRIM28Q13263 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRIM28Q13263 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TRIM28Q13263 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TRIM28Q13263 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
TRIM28Q13263 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TRIM28Q13263 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRIM28Q13263 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TRIM28Q13263 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRIM28Q13263 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRIM28Q13263 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
TRIM28Q13263 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRIM28Q13263 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRIM28Q13263 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRIM28Q13263 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRIM28Q13263 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
TRIM28Q13263 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRIM28Q13263 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRIM28Q13263 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
TRIM28Q13263 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRIM28Q13263 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIM28Q13263 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIM28Q13263 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIM28Q13263 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIM28Q13263 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRIM28Q13263 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRIM28Q13263 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
TRIM28Q13263 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRIM28Q13263 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRIM28Q13263 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM28Q13263 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM28Q13263 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRIM28Q13263 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM28Q13263 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM28Q13263 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM28Q13263 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM28Q13263 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRIM28Q13263 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRIM28Q13263 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRIM28Q13263 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRIM28Q13263 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRIM28Q13263 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM28Q13263 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM28Q13263 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM28Q13263 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM28Q13263 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM28Q13263 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRIM28Q13263 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRIM28Q13263 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM28Q13263 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM28Q13263 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRIM28Q13263 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRIM28Q13263 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRIM28Q13263 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRIM28Q13263 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRIM28Q13263 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRIM28Q13263 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRIM28Q13263 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRIM28Q13263 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRIM28Q13263 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRIM28Q13263 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRIM28Q13263 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRIM28Q13263 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRIM28Q13263 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRIM28Q13263 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TRIM28Q13263 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRIM28Q13263 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRIM28Q13263 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TRIM28Q13263 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRIM28Q13263 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TRIM28Q13263 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRIM28Q13263 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRIM28Q13263 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRIM28Q13263 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRIM28Q13263 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TRIM28Q13263 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
TRIM28Q13263 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRIM28Q13263 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRIM28Q13263 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TRIM28Q13263 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRIM28Q13263 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRIM28Q13263 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRIM28Q13263 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRIM28Q13263 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRIM28Q13263 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRIM28Q13263 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRIM28Q13263 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM28Q13263 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM28Q13263 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRIM28Q13263 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRIM28Q13263 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRIM28Q13263 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRIM28Q13263 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRIM28Q13263 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRIM28Q13263 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
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