Protein–RNA interactions for Protein: Q13239

SLA, Src-like-adapter, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAQ13239 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLAQ13239 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLAQ13239 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLAQ13239 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLAQ13239 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLAQ13239 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLAQ13239 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLAQ13239 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLAQ13239 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLAQ13239 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLAQ13239 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLAQ13239 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLAQ13239 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLAQ13239 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLAQ13239 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLAQ13239 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLAQ13239 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLAQ13239 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLAQ13239 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLAQ13239 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLAQ13239 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLAQ13239 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLAQ13239 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLAQ13239 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLAQ13239 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLAQ13239 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLAQ13239 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLAQ13239 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLAQ13239 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLAQ13239 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLAQ13239 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLAQ13239 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLAQ13239 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLAQ13239 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLAQ13239 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SLAQ13239 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLAQ13239 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLAQ13239 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLAQ13239 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLAQ13239 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLAQ13239 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLAQ13239 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLAQ13239 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLAQ13239 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLAQ13239 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLAQ13239 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLAQ13239 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLAQ13239 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLAQ13239 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLAQ13239 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLAQ13239 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLAQ13239 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLAQ13239 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLAQ13239 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLAQ13239 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLAQ13239 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLAQ13239 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLAQ13239 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLAQ13239 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLAQ13239 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SLAQ13239 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLAQ13239 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLAQ13239 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLAQ13239 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLAQ13239 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLAQ13239 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLAQ13239 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLAQ13239 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLAQ13239 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLAQ13239 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLAQ13239 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLAQ13239 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SLAQ13239 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLAQ13239 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLAQ13239 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLAQ13239 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLAQ13239 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLAQ13239 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLAQ13239 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLAQ13239 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLAQ13239 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLAQ13239 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLAQ13239 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLAQ13239 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLAQ13239 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLAQ13239 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLAQ13239 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLAQ13239 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLAQ13239 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLAQ13239 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLAQ13239 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLAQ13239 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLAQ13239 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLAQ13239 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SLAQ13239 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLAQ13239 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLAQ13239 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLAQ13239 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLAQ13239 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLAQ13239 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms