Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALCOCO2Q13137 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALCOCO2Q13137 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CALCOCO2Q13137 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CALCOCO2Q13137 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CALCOCO2Q13137 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CALCOCO2Q13137 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CALCOCO2Q13137 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CALCOCO2Q13137 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CALCOCO2Q13137 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CALCOCO2Q13137 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALCOCO2Q13137 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALCOCO2Q13137 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALCOCO2Q13137 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CALCOCO2Q13137 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALCOCO2Q13137 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALCOCO2Q13137 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CALCOCO2Q13137 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CALCOCO2Q13137 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CALCOCO2Q13137 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CALCOCO2Q13137 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CALCOCO2Q13137 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CALCOCO2Q13137 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CALCOCO2Q13137 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CALCOCO2Q13137 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CALCOCO2Q13137 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALCOCO2Q13137 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALCOCO2Q13137 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CALCOCO2Q13137 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CALCOCO2Q13137 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CALCOCO2Q13137 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CALCOCO2Q13137 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CALCOCO2Q13137 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CALCOCO2Q13137 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CALCOCO2Q13137 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CALCOCO2Q13137 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CALCOCO2Q13137 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CALCOCO2Q13137 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALCOCO2Q13137 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALCOCO2Q13137 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALCOCO2Q13137 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CALCOCO2Q13137 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CALCOCO2Q13137 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CALCOCO2Q13137 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CALCOCO2Q13137 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CALCOCO2Q13137 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CALCOCO2Q13137 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CALCOCO2Q13137 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CALCOCO2Q13137 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CALCOCO2Q13137 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CALCOCO2Q13137 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CALCOCO2Q13137 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CALCOCO2Q13137 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CALCOCO2Q13137 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALCOCO2Q13137 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALCOCO2Q13137 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CALCOCO2Q13137 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CALCOCO2Q13137 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CALCOCO2Q13137 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALCOCO2Q13137 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CALCOCO2Q13137 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CALCOCO2Q13137 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CALCOCO2Q13137 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CALCOCO2Q13137 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALCOCO2Q13137 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALCOCO2Q13137 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALCOCO2Q13137 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALCOCO2Q13137 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CALCOCO2Q13137 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CALCOCO2Q13137 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CALCOCO2Q13137 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CALCOCO2Q13137 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CALCOCO2Q13137 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CALCOCO2Q13137 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CALCOCO2Q13137 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CALCOCO2Q13137 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CALCOCO2Q13137 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CALCOCO2Q13137 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CALCOCO2Q13137 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CALCOCO2Q13137 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALCOCO2Q13137 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALCOCO2Q13137 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALCOCO2Q13137 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CALCOCO2Q13137 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CALCOCO2Q13137 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALCOCO2Q13137 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALCOCO2Q13137 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALCOCO2Q13137 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALCOCO2Q13137 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CALCOCO2Q13137 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CALCOCO2Q13137 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CALCOCO2Q13137 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CALCOCO2Q13137 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CALCOCO2Q13137 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CALCOCO2Q13137 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CALCOCO2Q13137 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CALCOCO2Q13137 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CALCOCO2Q13137 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CALCOCO2Q13137 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CALCOCO2Q13137 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
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