Protein–RNA interactions for Protein: Q13065

GAGE1, G antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAGE1Q13065 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GAGE1Q13065 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GAGE1Q13065 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GAGE1Q13065 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GAGE1Q13065 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GAGE1Q13065 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GAGE1Q13065 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GAGE1Q13065 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GAGE1Q13065 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GAGE1Q13065 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GAGE1Q13065 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GAGE1Q13065 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GAGE1Q13065 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GAGE1Q13065 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GAGE1Q13065 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GAGE1Q13065 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GAGE1Q13065 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GAGE1Q13065 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GAGE1Q13065 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GAGE1Q13065 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GAGE1Q13065 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GAGE1Q13065 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GAGE1Q13065 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GAGE1Q13065 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GAGE1Q13065 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GAGE1Q13065 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GAGE1Q13065 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GAGE1Q13065 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GAGE1Q13065 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GAGE1Q13065 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GAGE1Q13065 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GAGE1Q13065 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GAGE1Q13065 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GAGE1Q13065 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GAGE1Q13065 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GAGE1Q13065 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GAGE1Q13065 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GAGE1Q13065 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GAGE1Q13065 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GAGE1Q13065 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GAGE1Q13065 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GAGE1Q13065 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GAGE1Q13065 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GAGE1Q13065 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GAGE1Q13065 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GAGE1Q13065 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GAGE1Q13065 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GAGE1Q13065 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GAGE1Q13065 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GAGE1Q13065 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GAGE1Q13065 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GAGE1Q13065 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GAGE1Q13065 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GAGE1Q13065 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GAGE1Q13065 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GAGE1Q13065 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GAGE1Q13065 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GAGE1Q13065 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GAGE1Q13065 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GAGE1Q13065 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GAGE1Q13065 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GAGE1Q13065 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GAGE1Q13065 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GAGE1Q13065 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GAGE1Q13065 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GAGE1Q13065 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GAGE1Q13065 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GAGE1Q13065 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GAGE1Q13065 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GAGE1Q13065 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GAGE1Q13065 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GAGE1Q13065 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GAGE1Q13065 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GAGE1Q13065 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GAGE1Q13065 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GAGE1Q13065 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GAGE1Q13065 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GAGE1Q13065 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GAGE1Q13065 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GAGE1Q13065 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GAGE1Q13065 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GAGE1Q13065 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GAGE1Q13065 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GAGE1Q13065 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GAGE1Q13065 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GAGE1Q13065 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GAGE1Q13065 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GAGE1Q13065 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GAGE1Q13065 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GAGE1Q13065 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GAGE1Q13065 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GAGE1Q13065 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GAGE1Q13065 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GAGE1Q13065 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GAGE1Q13065 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GAGE1Q13065 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GAGE1Q13065 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GAGE1Q13065 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GAGE1Q13065 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GAGE1Q13065 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms