Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 OYE3YPL171C 1203 nt10.76□□□□□ -0.69
SSF2Q12153 MET8YBR213W 825 nt10.76□□□□□ -0.69
SSF2Q12153 YJL055WYJL055W 738 nt10.74□□□□□ -0.69
SSF2Q12153 STE4YOR212W 1272 nt10.74□□□□□ -0.69
SSF2Q12153 HXT12YIL170W 1374 nt10.74□□□□□ -0.69
SSF2Q12153 CSM1YCR086W 573 nt10.73□□□□□ -0.69
SSF2Q12153 PET8YNL003C 855 nt10.73□□□□□ -0.69
SSF2Q12153 NUC1YJL208C 990 nt10.72□□□□□ -0.69
SSF2Q12153 LSB5YCL034W 1065 nt10.72□□□□□ -0.69
SSF2Q12153 BNI5YNL166C 1347 nt10.72□□□□□ -0.69
SSF2Q12153 YJL067WYJL067W 351 nt10.71□□□□□ -0.69
SSF2Q12153 SEC61YLR378C 1443 nt10.71□□□□□ -0.69
SSF2Q12153 PHO23YNL097C 993 nt10.68□□□□□ -0.7
SSF2Q12153 MCH5YOR306C 1566 nt10.68□□□□□ -0.7
SSF2Q12153 YEL008WYEL008W 381 nt10.67□□□□□ -0.7
SSF2Q12153 YJR154WYJR154W 1041 nt10.67□□□□□ -0.7
SSF2Q12153 RAD51YER095W 1203 nt10.65□□□□□ -0.7
SSF2Q12153 YLR349WYLR349W 507 nt10.65□□□□□ -0.7
SSF2Q12153 MSC1YML128C 1542 nt10.64□□□□□ -0.71
SSF2Q12153 RPT5YOR117W 1305 nt10.64□□□□□ -0.71
SSF2Q12153 OXA1YER154W 1209 nt10.64□□□□□ -0.71
SSF2Q12153 YJL118WYJL118W 660 nt10.63□□□□□ -0.71
SSF2Q12153 YER188WYER188W 720 nt10.62□□□□□ -0.71
SSF2Q12153 CWC15YDR163W 528 nt10.61□□□□□ -0.71
SSF2Q12153 ADH7YCR105W 1086 nt10.6□□□□□ -0.71
SSF2Q12153 RAS2YNL098C 969 nt10.6□□□□□ -0.71
SSF2Q12153 GPN2YOR262W 1044 nt10.6□□□□□ -0.71
SSF2Q12153 YAT1YAR035W 2064 nt10.59□□□□□ -0.71
SSF2Q12153 RSC8YFR037C 1674 nt10.58□□□□□ -0.72
SSF2Q12153 DLD2YDL178W 1593 nt10.58□□□□□ -0.72
SSF2Q12153 FUB1YCR076C 753 nt10.58□□□□□ -0.72
SSF2Q12153 RIB7YBR153W 735 nt10.58□□□□□ -0.72
SSF2Q12153 INA1YLR413W 2028 nt10.58□□□□□ -0.72
SSF2Q12153 FLR1YBR008C 1647 nt10.58□□□□□ -0.72
SSF2Q12153 SAM3YPL274W 1764 nt10.57□□□□□ -0.72
SSF2Q12153 YGR139WYGR139W 339 nt10.57□□□□□ -0.72
SSF2Q12153 PAU15YIR041W 375 nt10.56□□□□□ -0.72
SSF2Q12153 SPP2YOR148C 558 nt10.56□□□□□ -0.72
SSF2Q12153 GAL3YDR009W 1563 nt10.56□□□□□ -0.72
SSF2Q12153 FMS1YMR020W 1527 nt10.55□□□□□ -0.72
SSF2Q12153 CPD1YGR247W 720 nt10.55□□□□□ -0.72
SSF2Q12153 YPS3YLR121C 1527 nt10.53□□□□□ -0.72
SSF2Q12153 OYE2YHR179W 1203 nt10.53□□□□□ -0.72
SSF2Q12153 TPS1YBR126C 1488 nt10.52□□□□□ -0.73
SSF2Q12153 OSH7YHR001W 1314 nt10.52□□□□□ -0.73
SSF2Q12153 CCT5YJR064W 1689 nt10.5□□□□□ -0.73
SSF2Q12153 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt10.48□□□□□ -0.73
SSF2Q12153 EAF3YPR023C 1206 nt10.48□□□□□ -0.73
SSF2Q12153 VPS62YGR141W 1404 nt10.46□□□□□ -0.74
SSF2Q12153 RPC82YPR190C 1965 nt10.45□□□□□ -0.74
SSF2Q12153 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.44□□□□□ -0.74
SSF2Q12153 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.44□□□□□ -0.74
SSF2Q12153 HEM13YDR044W 987 nt10.44□□□□□ -0.74
SSF2Q12153 THI72YOR192C 1800 nt10.44□□□□□ -0.74
SSF2Q12153 SOL2YCR073W-A 948 nt10.43□□□□□ -0.74
SSF2Q12153 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt10.43□□□□□ -0.74
SSF2Q12153 ACH1YBL015W 1581 nt10.43□□□□□ -0.74
SSF2Q12153 LSM5YER146W 282 nt10.41□□□□□ -0.74
SSF2Q12153 TAF13YML098W 504 nt10.4□□□□□ -0.74
SSF2Q12153 SNZ1YMR096W 894 nt10.4□□□□□ -0.74
SSF2Q12153 DDI1YER143W 1287 nt10.39□□□□□ -0.75
SSF2Q12153 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt10.39□□□□□ -0.75
SSF2Q12153 GID7YCL039W 2238 nt10.39□□□□□ -0.75
SSF2Q12153 YDL086WYDL086W 822 nt10.38□□□□□ -0.75
SSF2Q12153 TMA23YMR269W 636 nt10.38□□□□□ -0.75
SSF2Q12153 SPT20YOL148C 1815 nt10.37□□□□□ -0.75
SSF2Q12153 DAK2YFL053W 1776 nt10.35□□□□□ -0.75
SSF2Q12153 TAT2YOL020W 1779 nt10.35□□□□□ -0.75
SSF2Q12153 YPR126CYPR126C 309 nt10.35□□□□□ -0.75
SSF2Q12153 ESBP6YNL125C 2022 nt10.34□□□□□ -0.75
SSF2Q12153 ESS1YJR017C 513 nt10.34□□□□□ -0.75
SSF2Q12153 YOR325WYOR325W 474 nt10.34□□□□□ -0.75
SSF2Q12153 ASP3-1YLR155C 1089 nt10.33□□□□□ -0.76
SSF2Q12153 ASP3-2YLR157C 1089 nt10.33□□□□□ -0.76
SSF2Q12153 ASP3-3YLR158C 1089 nt10.33□□□□□ -0.76
SSF2Q12153 ASP3-4YLR160C 1089 nt10.33□□□□□ -0.76
SSF2Q12153 YNL024CYNL024C 741 nt10.33□□□□□ -0.76
SSF2Q12153 CCT2YIL142W 1584 nt10.32□□□□□ -0.76
SSF2Q12153 MCM5YLR274W 2328 nt10.32□□□□□ -0.76
SSF2Q12153 ILV3YJR016C 1758 nt10.31□□□□□ -0.76
SSF2Q12153 CMP2YML057W 1815 nt10.31□□□□□ -0.76
SSF2Q12153 PAU5YFL020C 369 nt10.31□□□□□ -0.76
SSF2Q12153 IML3YBR107C 738 nt10.31□□□□□ -0.76
SSF2Q12153 CTI6YPL181W 1521 nt10.31□□□□□ -0.76
SSF2Q12153 YDR455CYDR455C 309 nt10.3□□□□□ -0.76
SSF2Q12153 IMO32YGR031W 1029 nt10.3□□□□□ -0.76
SSF2Q12153 MHF1YOL086W-A 273 nt10.29□□□□□ -0.76
SSF2Q12153 OPI10YOL032W 741 nt10.28□□□□□ -0.76
SSF2Q12153 POT1YIL160C 1254 nt10.27□□□□□ -0.77
SSF2Q12153 YMR262WYMR262W 942 nt10.27□□□□□ -0.77
SSF2Q12153 PAB1YER165W 1734 nt10.26□□□□□ -0.77
SSF2Q12153 AIM1YAL046C 357 nt10.25□□□□□ -0.77
SSF2Q12153 RSC4YKR008W 1878 nt10.25□□□□□ -0.77
SSF2Q12153 ERG13YML126C 1476 nt10.24□□□□□ -0.77
SSF2Q12153 PGC1YPL206C 966 nt10.24□□□□□ -0.77
SSF2Q12153 ADE8YDR408C 645 nt10.23□□□□□ -0.77
SSF2Q12153 MUP1YGR055W 1725 nt10.23□□□□□ -0.77
SSF2Q12153 CSM2YIL132C 642 nt10.22□□□□□ -0.77
SSF2Q12153 STP3YLR375W 1032 nt10.22□□□□□ -0.77
SSF2Q12153 RRT8YOL048C 1029 nt10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 131.5 ms