Protein–RNA interactions for Protein: Q12004

TFB4, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB4, yeastyeast

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB4Q12004 SLX1YBR228W 915 nt10.29□□□□□ -0.76
TFB4Q12004 TIM17YJL143W 477 nt10.28□□□□□ -0.76
TFB4Q12004 PEX12YMR026C 1200 nt10.28□□□□□ -0.76
TFB4Q12004 YLR283WYLR283W 945 nt10.27□□□□□ -0.77
TFB4Q12004 FRE6YLL051C 2139 nt10.25□□□□□ -0.77
TFB4Q12004 MAF1YDR005C 1188 nt10.25□□□□□ -0.77
TFB4Q12004 YOL107WYOL107W 1029 nt10.25□□□□□ -0.77
TFB4Q12004 PRM4YPL156C 855 nt10.25□□□□□ -0.77
TFB4Q12004 DLD2YDL178W 1593 nt10.25□□□□□ -0.77
TFB4Q12004 DAT1YML113W 747 nt10.23□□□□□ -0.77
TFB4Q12004 MIX17YMR002W 471 nt10.23□□□□□ -0.77
TFB4Q12004 YNL319WYNL319W 441 nt10.23□□□□□ -0.77
TFB4Q12004 PZF1YPR186C 1290 nt10.23□□□□□ -0.77
TFB4Q12004 PAU7YAR020C 168 nt10.22□□□□□ -0.77
TFB4Q12004 HEL2YDR266C 1920 nt10.21□□□□□ -0.77
TFB4Q12004 ECM9YKR004C 1134 nt10.21□□□□□ -0.77
TFB4Q12004 MSA2YKR077W 1092 nt10.21□□□□□ -0.77
TFB4Q12004 LIP2YLR239C 987 nt10.21□□□□□ -0.77
TFB4Q12004 CWC25YNL245C 540 nt10.21□□□□□ -0.77
TFB4Q12004 SFP1YLR403W 2052 nt10.21□□□□□ -0.78
TFB4Q12004 YNL303WYNL303W 348 nt10.2□□□□□ -0.78
TFB4Q12004 OSW1YOR255W 837 nt10.2□□□□□ -0.78
TFB4Q12004 DSE3YOR264W 1293 nt10.2□□□□□ -0.78
TFB4Q12004 snR34snR34 203 nt10.2□□□□□ -0.78
TFB4Q12004 MIC12YBR262C 321 nt10.2□□□□□ -0.78
TFB4Q12004 NPP1YCR026C 2229 nt10.19□□□□□ -0.78
TFB4Q12004 UBA4YHR111W 1323 nt10.19□□□□□ -0.78
TFB4Q12004 CSI1YMR025W 888 nt10.19□□□□□ -0.78
TFB4Q12004 SHM2YLR058C 1410 nt10.18□□□□□ -0.78
TFB4Q12004 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.18□□□□□ -0.78
TFB4Q12004 YMR244WYMR244W 1068 nt10.18□□□□□ -0.78
TFB4Q12004 SWE1YJL187C 2460 nt10.18□□□□□ -0.78
TFB4Q12004 YGL034CYGL034C 366 nt10.17□□□□□ -0.78
TFB4Q12004 RAI1YGL246C 1164 nt10.17□□□□□ -0.78
TFB4Q12004 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt10.17□□□□□ -0.78
TFB4Q12004 SUT2YPR009W 807 nt10.17□□□□□ -0.78
TFB4Q12004 BNA2YJR078W 1362 nt10.16□□□□□ -0.78
TFB4Q12004 ALG7YBR243C 1347 nt10.16□□□□□ -0.78
TFB4Q12004 GID7YCL039W 2238 nt10.15□□□□□ -0.78
TFB4Q12004 XDJ1YLR090W 1380 nt10.15□□□□□ -0.78
TFB4Q12004 SHB17YKR043C 816 nt10.15□□□□□ -0.78
TFB4Q12004 NAR1YNL240C 1476 nt10.15□□□□□ -0.78
TFB4Q12004 HSP60YLR259C 1719 nt10.14□□□□□ -0.79
TFB4Q12004 RMA1YKL132C 1293 nt10.14□□□□□ -0.79
TFB4Q12004 YAT1YAR035W 2064 nt10.13□□□□□ -0.79
TFB4Q12004 YLR460CYLR460C 1131 nt10.13□□□□□ -0.79
TFB4Q12004 snR189snR189 189 nt10.13□□□□□ -0.79
TFB4Q12004 PRE2YPR103W 864 nt10.13□□□□□ -0.79
TFB4Q12004 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt10.12□□□□□ -0.79
TFB4Q12004 YGR201CYGR201C 678 nt10.12□□□□□ -0.79
TFB4Q12004 NIT1YIL164C 600 nt10.12□□□□□ -0.79
TFB4Q12004 SVF1YDR346C 1446 nt10.12□□□□□ -0.79
TFB4Q12004 GLR1YPL091W 1452 nt10.11□□□□□ -0.79
TFB4Q12004 RAX1YOR301W 1308 nt10.11□□□□□ -0.79
TFB4Q12004 RSC4YKR008W 1878 nt10.11□□□□□ -0.79
TFB4Q12004 YDR010CYDR010C 333 nt10.11□□□□□ -0.79
TFB4Q12004 YGR283CYGR283C 1026 nt10.11□□□□□ -0.79
TFB4Q12004 NMD4YLR363C 657 nt10.11□□□□□ -0.79
TFB4Q12004 ZTA1YBR046C 1005 nt10.11□□□□□ -0.79
TFB4Q12004 RER1YCL001W 567 nt10.11□□□□□ -0.79
TFB4Q12004 NUF2YOL069W 1356 nt10.1□□□□□ -0.79
TFB4Q12004 YSR3YKR053C 1215 nt10.09□□□□□ -0.79
TFB4Q12004 YLR169WYLR169W 354 nt10.09□□□□□ -0.79
TFB4Q12004 SGT2YOR007C 1041 nt10.09□□□□□ -0.79
TFB4Q12004 PEX22YAL055W 543 nt10.08□□□□□ -0.8
TFB4Q12004 GDH3YAL062W 1374 nt10.08□□□□□ -0.8
TFB4Q12004 RET2YFR051C 1641 nt10.07□□□□□ -0.8
TFB4Q12004 YCR087WYCR087W 516 nt10.06□□□□□ -0.8
TFB4Q12004 PUS9YDL036C 1389 nt10.04□□□□□ -0.8
TFB4Q12004 PTC7YHR076W 1032 nt10.04□□□□□ -0.8
TFB4Q12004 HHO1YPL127C 777 nt10.04□□□□□ -0.8
TFB4Q12004 MET2YNL277W 1461 nt10.04□□□□□ -0.8
TFB4Q12004 NDI1YML120C 1542 nt10.03□□□□□ -0.8
TFB4Q12004 VAM3YOR106W 852 nt10.03□□□□□ -0.8
TFB4Q12004 YIL092WYIL092W 1902 nt10.03□□□□□ -0.8
TFB4Q12004 ERG12YMR208W 1332 nt10.03□□□□□ -0.8
TFB4Q12004 CMP2YML057W 1815 nt10.03□□□□□ -0.8
TFB4Q12004 BUD16YEL029C 939 nt10.02□□□□□ -0.81
TFB4Q12004 XYL2YLR070C 1071 nt10.02□□□□□ -0.81
TFB4Q12004 NUR1YDL089W 1455 nt10.02□□□□□ -0.81
TFB4Q12004 HAT2YEL056W 1206 nt10.01□□□□□ -0.81
TFB4Q12004 RBG2YGR173W 1107 nt10.01□□□□□ -0.81
TFB4Q12004 ERG29YMR134W 714 nt10.01□□□□□ -0.81
TFB4Q12004 MCT1YOR221C 1083 nt10.01□□□□□ -0.81
TFB4Q12004 YMR210WYMR210W 1350 nt10.01□□□□□ -0.81
TFB4Q12004 YCR049CYCR049C 447 nt10□□□□□ -0.81
TFB4Q12004 YHR022CYHR022C 771 nt10□□□□□ -0.81
TFB4Q12004 IDI1YPL117C 867 nt10□□□□□ -0.81
TFB4Q12004 NUP57YGR119C 1626 nt10□□□□□ -0.81
TFB4Q12004 ARC35YNR035C 1029 nt9.99□□□□□ -0.81
TFB4Q12004 AIM45YPR004C 1035 nt9.99□□□□□ -0.81
TFB4Q12004 PHO89YBR296C 1725 nt9.99□□□□□ -0.81
TFB4Q12004 RBG1YAL036C 1110 nt9.98□□□□□ -0.81
TFB4Q12004 YKR104WYKR104W 921 nt9.98□□□□□ -0.81
TFB4Q12004 DSC2YOL073C 969 nt9.98□□□□□ -0.81
TFB4Q12004 ESBP6YNL125C 2022 nt9.97□□□□□ -0.81
TFB4Q12004 REX3YLR107W 1215 nt9.97□□□□□ -0.81
TFB4Q12004 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt9.97□□□□□ -0.81
TFB4Q12004 IRC14YOR135C 342 nt9.97□□□□□ -0.81
TFB4Q12004 ISA2YPR067W 558 nt9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 61.2 ms