Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMAGPQ0VAQ4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAGPQ0VAQ4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAGPQ0VAQ4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMAGPQ0VAQ4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAGPQ0VAQ4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SMAGPQ0VAQ4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAGPQ0VAQ4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAGPQ0VAQ4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMAGPQ0VAQ4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAGPQ0VAQ4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAGPQ0VAQ4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMAGPQ0VAQ4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMAGPQ0VAQ4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMAGPQ0VAQ4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMAGPQ0VAQ4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMAGPQ0VAQ4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMAGPQ0VAQ4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMAGPQ0VAQ4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMAGPQ0VAQ4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMAGPQ0VAQ4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMAGPQ0VAQ4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMAGPQ0VAQ4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMAGPQ0VAQ4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAGPQ0VAQ4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAGPQ0VAQ4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAGPQ0VAQ4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMAGPQ0VAQ4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAGPQ0VAQ4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAGPQ0VAQ4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SMAGPQ0VAQ4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAGPQ0VAQ4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAGPQ0VAQ4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAGPQ0VAQ4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMAGPQ0VAQ4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMAGPQ0VAQ4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMAGPQ0VAQ4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMAGPQ0VAQ4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMAGPQ0VAQ4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMAGPQ0VAQ4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMAGPQ0VAQ4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMAGPQ0VAQ4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAGPQ0VAQ4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMAGPQ0VAQ4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMAGPQ0VAQ4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMAGPQ0VAQ4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SMAGPQ0VAQ4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAGPQ0VAQ4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAGPQ0VAQ4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAGPQ0VAQ4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAGPQ0VAQ4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAGPQ0VAQ4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAGPQ0VAQ4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAGPQ0VAQ4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAGPQ0VAQ4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAGPQ0VAQ4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMAGPQ0VAQ4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMAGPQ0VAQ4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMAGPQ0VAQ4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMAGPQ0VAQ4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMAGPQ0VAQ4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SMAGPQ0VAQ4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAGPQ0VAQ4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAGPQ0VAQ4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMAGPQ0VAQ4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAGPQ0VAQ4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAGPQ0VAQ4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMAGPQ0VAQ4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAGPQ0VAQ4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMAGPQ0VAQ4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAGPQ0VAQ4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAGPQ0VAQ4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAGPQ0VAQ4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAGPQ0VAQ4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMAGPQ0VAQ4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAGPQ0VAQ4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAGPQ0VAQ4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAGPQ0VAQ4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAGPQ0VAQ4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAGPQ0VAQ4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAGPQ0VAQ4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAGPQ0VAQ4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAGPQ0VAQ4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAGPQ0VAQ4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SMAGPQ0VAQ4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SMAGPQ0VAQ4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAGPQ0VAQ4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAGPQ0VAQ4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAGPQ0VAQ4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAGPQ0VAQ4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAGPQ0VAQ4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAGPQ0VAQ4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAGPQ0VAQ4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAGPQ0VAQ4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAGPQ0VAQ4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAGPQ0VAQ4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAGPQ0VAQ4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAGPQ0VAQ4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAGPQ0VAQ4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAGPQ0VAQ4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms