Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUDPQ08623 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PUDPQ08623 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PUDPQ08623 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUDPQ08623 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUDPQ08623 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUDPQ08623 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PUDPQ08623 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PUDPQ08623 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUDPQ08623 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PUDPQ08623 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PUDPQ08623 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PUDPQ08623 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PUDPQ08623 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUDPQ08623 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUDPQ08623 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUDPQ08623 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUDPQ08623 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PUDPQ08623 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUDPQ08623 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PUDPQ08623 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PUDPQ08623 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PUDPQ08623 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUDPQ08623 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUDPQ08623 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUDPQ08623 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PUDPQ08623 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUDPQ08623 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PUDPQ08623 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUDPQ08623 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUDPQ08623 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUDPQ08623 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUDPQ08623 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PUDPQ08623 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PUDPQ08623 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUDPQ08623 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PUDPQ08623 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PUDPQ08623 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PUDPQ08623 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PUDPQ08623 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PUDPQ08623 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PUDPQ08623 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PUDPQ08623 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PUDPQ08623 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PUDPQ08623 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PUDPQ08623 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PUDPQ08623 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PUDPQ08623 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PUDPQ08623 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PUDPQ08623 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PUDPQ08623 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PUDPQ08623 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PUDPQ08623 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PUDPQ08623 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PUDPQ08623 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PUDPQ08623 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PUDPQ08623 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PUDPQ08623 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PUDPQ08623 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PUDPQ08623 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PUDPQ08623 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PUDPQ08623 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PUDPQ08623 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PUDPQ08623 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PUDPQ08623 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PUDPQ08623 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PUDPQ08623 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PUDPQ08623 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PUDPQ08623 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PUDPQ08623 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PUDPQ08623 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PUDPQ08623 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PUDPQ08623 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PUDPQ08623 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUDPQ08623 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PUDPQ08623 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUDPQ08623 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUDPQ08623 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUDPQ08623 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUDPQ08623 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PUDPQ08623 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUDPQ08623 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUDPQ08623 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUDPQ08623 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUDPQ08623 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUDPQ08623 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUDPQ08623 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUDPQ08623 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUDPQ08623 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUDPQ08623 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUDPQ08623 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUDPQ08623 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUDPQ08623 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUDPQ08623 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUDPQ08623 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUDPQ08623 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUDPQ08623 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUDPQ08623 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUDPQ08623 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUDPQ08623 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms