Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLEQ07864 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLEQ07864 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
POLEQ07864 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLEQ07864 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLEQ07864 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLEQ07864 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLEQ07864 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLEQ07864 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLEQ07864 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLEQ07864 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLEQ07864 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLEQ07864 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLEQ07864 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLEQ07864 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLEQ07864 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLEQ07864 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLEQ07864 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLEQ07864 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLEQ07864 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLEQ07864 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLEQ07864 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLEQ07864 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLEQ07864 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLEQ07864 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLEQ07864 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLEQ07864 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLEQ07864 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLEQ07864 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
POLEQ07864 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
POLEQ07864 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
POLEQ07864 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLEQ07864 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLEQ07864 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLEQ07864 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLEQ07864 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLEQ07864 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLEQ07864 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLEQ07864 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLEQ07864 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLEQ07864 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLEQ07864 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLEQ07864 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLEQ07864 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLEQ07864 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLEQ07864 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLEQ07864 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLEQ07864 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLEQ07864 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLEQ07864 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLEQ07864 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLEQ07864 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLEQ07864 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLEQ07864 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLEQ07864 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLEQ07864 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLEQ07864 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLEQ07864 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLEQ07864 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLEQ07864 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLEQ07864 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLEQ07864 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLEQ07864 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLEQ07864 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLEQ07864 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLEQ07864 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLEQ07864 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLEQ07864 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLEQ07864 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLEQ07864 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLEQ07864 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLEQ07864 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
POLEQ07864 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
POLEQ07864 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
POLEQ07864 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
POLEQ07864 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
POLEQ07864 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
POLEQ07864 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
POLEQ07864 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
POLEQ07864 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
POLEQ07864 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POLEQ07864 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLEQ07864 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLEQ07864 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POLEQ07864 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLEQ07864 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLEQ07864 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLEQ07864 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
POLEQ07864 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLEQ07864 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLEQ07864 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLEQ07864 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLEQ07864 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLEQ07864 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLEQ07864 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLEQ07864 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLEQ07864 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLEQ07864 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLEQ07864 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLEQ07864 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms