Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNB3Q05901 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNB3Q05901 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNB3Q05901 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNB3Q05901 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNB3Q05901 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNB3Q05901 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNB3Q05901 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNB3Q05901 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNB3Q05901 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNB3Q05901 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNB3Q05901 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNB3Q05901 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNB3Q05901 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNB3Q05901 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNB3Q05901 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNB3Q05901 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNB3Q05901 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNB3Q05901 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNB3Q05901 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHRNB3Q05901 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNB3Q05901 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNB3Q05901 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNB3Q05901 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNB3Q05901 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNB3Q05901 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNB3Q05901 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHRNB3Q05901 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNB3Q05901 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNB3Q05901 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNB3Q05901 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNB3Q05901 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNB3Q05901 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNB3Q05901 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNB3Q05901 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNB3Q05901 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNB3Q05901 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHRNB3Q05901 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNB3Q05901 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNB3Q05901 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CHRNB3Q05901 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNB3Q05901 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNB3Q05901 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNB3Q05901 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNB3Q05901 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNB3Q05901 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNB3Q05901 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNB3Q05901 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNB3Q05901 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNB3Q05901 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNB3Q05901 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNB3Q05901 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNB3Q05901 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNB3Q05901 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNB3Q05901 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNB3Q05901 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNB3Q05901 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNB3Q05901 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHRNB3Q05901 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNB3Q05901 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNB3Q05901 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNB3Q05901 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNB3Q05901 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNB3Q05901 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNB3Q05901 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNB3Q05901 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNB3Q05901 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNB3Q05901 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNB3Q05901 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNB3Q05901 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNB3Q05901 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNB3Q05901 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNB3Q05901 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNB3Q05901 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNB3Q05901 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNB3Q05901 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNB3Q05901 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNB3Q05901 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNB3Q05901 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNB3Q05901 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNB3Q05901 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNB3Q05901 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNB3Q05901 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNB3Q05901 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNB3Q05901 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNB3Q05901 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNB3Q05901 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNB3Q05901 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNB3Q05901 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNB3Q05901 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNB3Q05901 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNB3Q05901 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNB3Q05901 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNB3Q05901 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNB3Q05901 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNB3Q05901 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNB3Q05901 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNB3Q05901 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNB3Q05901 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHRNB3Q05901 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms