Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIN1Q05586 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIN1Q05586 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIN1Q05586 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIN1Q05586 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN1Q05586 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN1Q05586 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN1Q05586 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN1Q05586 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
GRIN1Q05586 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GRIN1Q05586 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GRIN1Q05586 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GRIN1Q05586 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN1Q05586 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIN1Q05586 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIN1Q05586 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIN1Q05586 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIN1Q05586 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIN1Q05586 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GRIN1Q05586 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIN1Q05586 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIN1Q05586 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GRIN1Q05586 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIN1Q05586 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIN1Q05586 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIN1Q05586 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
GRIN1Q05586 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIN1Q05586 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
GRIN1Q05586 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GRIN1Q05586 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GRIN1Q05586 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GRIN1Q05586 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GRIN1Q05586 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GRIN1Q05586 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
GRIN1Q05586 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN1Q05586 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN1Q05586 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIN1Q05586 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIN1Q05586 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIN1Q05586 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIN1Q05586 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIN1Q05586 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIN1Q05586 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIN1Q05586 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GRIN1Q05586 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIN1Q05586 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN1Q05586 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIN1Q05586 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIN1Q05586 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIN1Q05586 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIN1Q05586 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GRIN1Q05586 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GRIN1Q05586 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GRIN1Q05586 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GRIN1Q05586 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GRIN1Q05586 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GRIN1Q05586 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN1Q05586 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN1Q05586 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN1Q05586 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GRIN1Q05586 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GRIN1Q05586 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GRIN1Q05586 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GRIN1Q05586 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GRIN1Q05586 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIN1Q05586 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIN1Q05586 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRIN1Q05586 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIN1Q05586 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIN1Q05586 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIN1Q05586 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GRIN1Q05586 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
GRIN1Q05586 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GRIN1Q05586 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GRIN1Q05586 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GRIN1Q05586 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
GRIN1Q05586 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GRIN1Q05586 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GRIN1Q05586 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GRIN1Q05586 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GRIN1Q05586 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GRIN1Q05586 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GRIN1Q05586 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GRIN1Q05586 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GRIN1Q05586 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GRIN1Q05586 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
GRIN1Q05586 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GRIN1Q05586 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
GRIN1Q05586 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GRIN1Q05586 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GRIN1Q05586 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GRIN1Q05586 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN1Q05586 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GRIN1Q05586 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GRIN1Q05586 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GRIN1Q05586 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GRIN1Q05586 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GRIN1Q05586 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GRIN1Q05586 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GRIN1Q05586 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms