Protein–RNA interactions for Protein: Q01814

ATP2B2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B2Q01814 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ATP2B2Q01814 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ATP2B2Q01814 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
ATP2B2Q01814 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
ATP2B2Q01814 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ATP2B2Q01814 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ATP2B2Q01814 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ATP2B2Q01814 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ATP2B2Q01814 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ATP2B2Q01814 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ATP2B2Q01814 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ATP2B2Q01814 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ATP2B2Q01814 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ATP2B2Q01814 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ATP2B2Q01814 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ATP2B2Q01814 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ATP2B2Q01814 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ATP2B2Q01814 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
ATP2B2Q01814 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ATP2B2Q01814 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ATP2B2Q01814 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ATP2B2Q01814 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ATP2B2Q01814 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
ATP2B2Q01814 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ATP2B2Q01814 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ATP2B2Q01814 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ATP2B2Q01814 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ATP2B2Q01814 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ATP2B2Q01814 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ATP2B2Q01814 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ATP2B2Q01814 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ATP2B2Q01814 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.61
ATP2B2Q01814 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ATP2B2Q01814 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ATP2B2Q01814 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
ATP2B2Q01814 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ATP2B2Q01814 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ATP2B2Q01814 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
ATP2B2Q01814 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ATP2B2Q01814 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
ATP2B2Q01814 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ATP2B2Q01814 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
ATP2B2Q01814 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
ATP2B2Q01814 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
ATP2B2Q01814 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ATP2B2Q01814 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
ATP2B2Q01814 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ATP2B2Q01814 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ATP2B2Q01814 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ATP2B2Q01814 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ATP2B2Q01814 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ATP2B2Q01814 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ATP2B2Q01814 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ATP2B2Q01814 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
ATP2B2Q01814 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ATP2B2Q01814 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ATP2B2Q01814 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ATP2B2Q01814 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ATP2B2Q01814 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ATP2B2Q01814 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ATP2B2Q01814 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ATP2B2Q01814 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ATP2B2Q01814 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ATP2B2Q01814 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ATP2B2Q01814 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ATP2B2Q01814 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ATP2B2Q01814 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ATP2B2Q01814 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ATP2B2Q01814 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ATP2B2Q01814 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ATP2B2Q01814 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ATP2B2Q01814 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ATP2B2Q01814 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ATP2B2Q01814 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ATP2B2Q01814 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ATP2B2Q01814 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ATP2B2Q01814 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ATP2B2Q01814 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ATP2B2Q01814 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ATP2B2Q01814 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ATP2B2Q01814 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ATP2B2Q01814 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ATP2B2Q01814 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ATP2B2Q01814 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ATP2B2Q01814 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ATP2B2Q01814 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ATP2B2Q01814 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ATP2B2Q01814 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ATP2B2Q01814 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ATP2B2Q01814 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ATP2B2Q01814 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ATP2B2Q01814 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ATP2B2Q01814 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ATP2B2Q01814 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ATP2B2Q01814 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ATP2B2Q01814 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ATP2B2Q01814 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ATP2B2Q01814 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ATP2B2Q01814 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ATP2B2Q01814 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms