Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SRSF2Q01130 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF2Q01130 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF2Q01130 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF2Q01130 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRSF2Q01130 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRSF2Q01130 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRSF2Q01130 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRSF2Q01130 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF2Q01130 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF2Q01130 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF2Q01130 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF2Q01130 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SRSF2Q01130 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRSF2Q01130 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRSF2Q01130 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRSF2Q01130 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRSF2Q01130 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRSF2Q01130 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRSF2Q01130 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRSF2Q01130 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRSF2Q01130 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRSF2Q01130 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRSF2Q01130 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRSF2Q01130 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF2Q01130 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF2Q01130 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF2Q01130 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRSF2Q01130 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SRSF2Q01130 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRSF2Q01130 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRSF2Q01130 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRSF2Q01130 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRSF2Q01130 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRSF2Q01130 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRSF2Q01130 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRSF2Q01130 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF2Q01130 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF2Q01130 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF2Q01130 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF2Q01130 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF2Q01130 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRSF2Q01130 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRSF2Q01130 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRSF2Q01130 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRSF2Q01130 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SRSF2Q01130 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRSF2Q01130 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRSF2Q01130 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRSF2Q01130 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRSF2Q01130 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF2Q01130 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF2Q01130 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF2Q01130 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF2Q01130 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF2Q01130 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF2Q01130 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRSF2Q01130 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF2Q01130 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRSF2Q01130 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRSF2Q01130 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRSF2Q01130 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRSF2Q01130 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRSF2Q01130 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF2Q01130 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF2Q01130 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRSF2Q01130 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRSF2Q01130 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRSF2Q01130 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRSF2Q01130 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRSF2Q01130 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF2Q01130 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF2Q01130 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRSF2Q01130 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRSF2Q01130 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRSF2Q01130 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF2Q01130 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF2Q01130 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF2Q01130 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF2Q01130 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF2Q01130 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF2Q01130 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF2Q01130 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF2Q01130 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF2Q01130 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF2Q01130 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF2Q01130 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF2Q01130 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF2Q01130 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF2Q01130 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF2Q01130 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF2Q01130 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRSF2Q01130 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRSF2Q01130 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRSF2Q01130 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF2Q01130 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF2Q01130 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF2Q01130 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF2Q01130 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRSF2Q01130 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms