Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NUCB2P80303 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
NUCB2P80303 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NUCB2P80303 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
NUCB2P80303 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NUCB2P80303 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NUCB2P80303 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NUCB2P80303 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NUCB2P80303 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NUCB2P80303 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NUCB2P80303 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NUCB2P80303 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NUCB2P80303 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NUCB2P80303 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NUCB2P80303 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NUCB2P80303 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
NUCB2P80303 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
NUCB2P80303 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NUCB2P80303 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NUCB2P80303 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NUCB2P80303 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NUCB2P80303 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NUCB2P80303 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NUCB2P80303 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NUCB2P80303 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NUCB2P80303 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NUCB2P80303 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NUCB2P80303 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NUCB2P80303 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NUCB2P80303 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NUCB2P80303 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NUCB2P80303 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NUCB2P80303 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NUCB2P80303 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NUCB2P80303 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NUCB2P80303 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NUCB2P80303 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NUCB2P80303 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
NUCB2P80303 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NUCB2P80303 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NUCB2P80303 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NUCB2P80303 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NUCB2P80303 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NUCB2P80303 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NUCB2P80303 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NUCB2P80303 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUCB2P80303 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUCB2P80303 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NUCB2P80303 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NUCB2P80303 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NUCB2P80303 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NUCB2P80303 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NUCB2P80303 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NUCB2P80303 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NUCB2P80303 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NUCB2P80303 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NUCB2P80303 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NUCB2P80303 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NUCB2P80303 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NUCB2P80303 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NUCB2P80303 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NUCB2P80303 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NUCB2P80303 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NUCB2P80303 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NUCB2P80303 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NUCB2P80303 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NUCB2P80303 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NUCB2P80303 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NUCB2P80303 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NUCB2P80303 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NUCB2P80303 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NUCB2P80303 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
NUCB2P80303 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
NUCB2P80303 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
NUCB2P80303 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NUCB2P80303 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NUCB2P80303 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NUCB2P80303 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NUCB2P80303 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NUCB2P80303 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NUCB2P80303 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NUCB2P80303 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NUCB2P80303 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NUCB2P80303 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NUCB2P80303 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NUCB2P80303 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NUCB2P80303 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NUCB2P80303 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
NUCB2P80303 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NUCB2P80303 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NUCB2P80303 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NUCB2P80303 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUCB2P80303 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NUCB2P80303 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
NUCB2P80303 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NUCB2P80303 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NUCB2P80303 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NUCB2P80303 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NUCB2P80303 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NUCB2P80303 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms