Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
PIP4K2BP78356 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
PIP4K2BP78356 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
PIP4K2BP78356 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
PIP4K2BP78356 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC38.25■■■■□ 3.71
PIP4K2BP78356 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
PIP4K2BP78356 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PIP4K2BP78356 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
PIP4K2BP78356 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
PIP4K2BP78356 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PIP4K2BP78356 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PIP4K2BP78356 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
PIP4K2BP78356 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
PIP4K2BP78356 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
PIP4K2BP78356 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
PIP4K2BP78356 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
PIP4K2BP78356 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
PIP4K2BP78356 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
PIP4K2BP78356 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
PIP4K2BP78356 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
PIP4K2BP78356 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PIP4K2BP78356 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
PIP4K2BP78356 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
PIP4K2BP78356 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
PIP4K2BP78356 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
PIP4K2BP78356 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
PIP4K2BP78356 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PIP4K2BP78356 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
PIP4K2BP78356 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
PIP4K2BP78356 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PIP4K2BP78356 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
PIP4K2BP78356 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC38.05■■■■□ 3.68
PIP4K2BP78356 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
PIP4K2BP78356 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
PIP4K2BP78356 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
PIP4K2BP78356 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PIP4K2BP78356 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PIP4K2BP78356 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
PIP4K2BP78356 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PIP4K2BP78356 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
PIP4K2BP78356 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PIP4K2BP78356 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PIP4K2BP78356 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.68
PIP4K2BP78356 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PIP4K2BP78356 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PIP4K2BP78356 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PIP4K2BP78356 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PIP4K2BP78356 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PIP4K2BP78356 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
PIP4K2BP78356 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PIP4K2BP78356 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PIP4K2BP78356 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PIP4K2BP78356 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PIP4K2BP78356 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
PIP4K2BP78356 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
PIP4K2BP78356 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
PIP4K2BP78356 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
PIP4K2BP78356 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
PIP4K2BP78356 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
PIP4K2BP78356 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
PIP4K2BP78356 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
PIP4K2BP78356 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
PIP4K2BP78356 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
PIP4K2BP78356 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PIP4K2BP78356 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
PIP4K2BP78356 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
PIP4K2BP78356 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
PIP4K2BP78356 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
PIP4K2BP78356 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
PIP4K2BP78356 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
PIP4K2BP78356 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
PIP4K2BP78356 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
PIP4K2BP78356 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
PIP4K2BP78356 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PIP4K2BP78356 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
PIP4K2BP78356 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
PIP4K2BP78356 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
PIP4K2BP78356 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC37.9■■■■□ 3.66
PIP4K2BP78356 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PIP4K2BP78356 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PIP4K2BP78356 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PIP4K2BP78356 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PIP4K2BP78356 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
PIP4K2BP78356 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PIP4K2BP78356 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PIP4K2BP78356 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PIP4K2BP78356 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.82■■■■□ 3.64
PIP4K2BP78356 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
PIP4K2BP78356 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
PIP4K2BP78356 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
PIP4K2BP78356 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
PIP4K2BP78356 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
PIP4K2BP78356 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PIP4K2BP78356 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
PIP4K2BP78356 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC37.78■■■■□ 3.64
PIP4K2BP78356 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PIP4K2BP78356 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PIP4K2BP78356 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
PIP4K2BP78356 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
PIP4K2BP78356 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms