Protein–RNA interactions for Protein: P62888

RPL30, 60S ribosomal protein L30, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL30P62888 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL30P62888 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPL30P62888 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL30P62888 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL30P62888 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL30P62888 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL30P62888 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL30P62888 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL30P62888 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL30P62888 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL30P62888 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL30P62888 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL30P62888 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL30P62888 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL30P62888 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL30P62888 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL30P62888 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL30P62888 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL30P62888 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL30P62888 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL30P62888 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL30P62888 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL30P62888 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL30P62888 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPL30P62888 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPL30P62888 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL30P62888 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL30P62888 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL30P62888 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL30P62888 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL30P62888 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL30P62888 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL30P62888 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL30P62888 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL30P62888 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RPL30P62888 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL30P62888 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL30P62888 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL30P62888 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL30P62888 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL30P62888 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL30P62888 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL30P62888 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL30P62888 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL30P62888 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL30P62888 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL30P62888 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL30P62888 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL30P62888 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL30P62888 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPL30P62888 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPL30P62888 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL30P62888 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPL30P62888 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL30P62888 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL30P62888 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPL30P62888 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPL30P62888 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL30P62888 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL30P62888 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL30P62888 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL30P62888 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL30P62888 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL30P62888 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL30P62888 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPL30P62888 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL30P62888 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPL30P62888 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL30P62888 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL30P62888 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL30P62888 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL30P62888 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL30P62888 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL30P62888 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL30P62888 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL30P62888 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL30P62888 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL30P62888 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL30P62888 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL30P62888 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL30P62888 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL30P62888 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL30P62888 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL30P62888 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPL30P62888 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPL30P62888 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL30P62888 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL30P62888 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL30P62888 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL30P62888 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL30P62888 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL30P62888 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL30P62888 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL30P62888 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL30P62888 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL30P62888 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL30P62888 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL30P62888 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL30P62888 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL30P62888 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms