Protein–RNA interactions for Protein: P61962

DCAF7, DDB1- and CUL4-associated factor 7, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF7P61962 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCAF7P61962 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCAF7P61962 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCAF7P61962 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCAF7P61962 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCAF7P61962 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCAF7P61962 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCAF7P61962 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCAF7P61962 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCAF7P61962 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCAF7P61962 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCAF7P61962 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCAF7P61962 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCAF7P61962 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCAF7P61962 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCAF7P61962 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCAF7P61962 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCAF7P61962 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCAF7P61962 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCAF7P61962 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DCAF7P61962 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DCAF7P61962 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DCAF7P61962 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DCAF7P61962 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCAF7P61962 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCAF7P61962 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCAF7P61962 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCAF7P61962 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCAF7P61962 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCAF7P61962 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DCAF7P61962 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCAF7P61962 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DCAF7P61962 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCAF7P61962 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCAF7P61962 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCAF7P61962 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCAF7P61962 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DCAF7P61962 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DCAF7P61962 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DCAF7P61962 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DCAF7P61962 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCAF7P61962 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCAF7P61962 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCAF7P61962 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCAF7P61962 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DCAF7P61962 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCAF7P61962 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCAF7P61962 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCAF7P61962 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DCAF7P61962 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DCAF7P61962 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCAF7P61962 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCAF7P61962 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DCAF7P61962 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCAF7P61962 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DCAF7P61962 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCAF7P61962 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCAF7P61962 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DCAF7P61962 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCAF7P61962 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCAF7P61962 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DCAF7P61962 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DCAF7P61962 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCAF7P61962 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DCAF7P61962 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DCAF7P61962 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DCAF7P61962 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DCAF7P61962 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCAF7P61962 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DCAF7P61962 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
DCAF7P61962 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCAF7P61962 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCAF7P61962 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCAF7P61962 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCAF7P61962 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DCAF7P61962 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCAF7P61962 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCAF7P61962 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCAF7P61962 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCAF7P61962 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCAF7P61962 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCAF7P61962 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCAF7P61962 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCAF7P61962 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DCAF7P61962 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCAF7P61962 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCAF7P61962 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCAF7P61962 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCAF7P61962 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCAF7P61962 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCAF7P61962 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCAF7P61962 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DCAF7P61962 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCAF7P61962 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DCAF7P61962 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCAF7P61962 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCAF7P61962 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCAF7P61962 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCAF7P61962 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCAF7P61962 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms