Protein–RNA interactions for Protein: P58511

SMIM11A, Small integral membrane protein 11A, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM11AP58511 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMIM11AP58511 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMIM11AP58511 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMIM11AP58511 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMIM11AP58511 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMIM11AP58511 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMIM11AP58511 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMIM11AP58511 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMIM11AP58511 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SMIM11AP58511 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMIM11AP58511 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMIM11AP58511 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMIM11AP58511 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMIM11AP58511 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMIM11AP58511 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMIM11AP58511 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMIM11AP58511 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMIM11AP58511 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMIM11AP58511 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SMIM11AP58511 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMIM11AP58511 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM11AP58511 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM11AP58511 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM11AP58511 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMIM11AP58511 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM11AP58511 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM11AP58511 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM11AP58511 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM11AP58511 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM11AP58511 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMIM11AP58511 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM11AP58511 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM11AP58511 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM11AP58511 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM11AP58511 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM11AP58511 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMIM11AP58511 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM11AP58511 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMIM11AP58511 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM11AP58511 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM11AP58511 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM11AP58511 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM11AP58511 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMIM11AP58511 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM11AP58511 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMIM11AP58511 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SMIM11AP58511 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMIM11AP58511 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMIM11AP58511 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMIM11AP58511 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMIM11AP58511 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMIM11AP58511 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM11AP58511 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMIM11AP58511 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM11AP58511 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM11AP58511 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM11AP58511 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM11AP58511 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMIM11AP58511 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM11AP58511 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM11AP58511 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM11AP58511 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM11AP58511 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMIM11AP58511 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMIM11AP58511 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM11AP58511 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM11AP58511 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM11AP58511 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM11AP58511 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM11AP58511 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM11AP58511 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM11AP58511 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMIM11AP58511 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM11AP58511 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM11AP58511 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMIM11AP58511 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM11AP58511 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMIM11AP58511 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM11AP58511 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM11AP58511 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM11AP58511 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM11AP58511 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM11AP58511 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM11AP58511 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMIM11AP58511 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM11AP58511 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM11AP58511 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM11AP58511 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMIM11AP58511 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMIM11AP58511 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM11AP58511 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM11AP58511 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM11AP58511 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMIM11AP58511 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMIM11AP58511 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM11AP58511 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM11AP58511 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMIM11AP58511 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMIM11AP58511 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMIM11AP58511 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms