Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HADHBP55084 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HADHBP55084 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HADHBP55084 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HADHBP55084 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HADHBP55084 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HADHBP55084 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HADHBP55084 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HADHBP55084 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HADHBP55084 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HADHBP55084 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HADHBP55084 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
HADHBP55084 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
HADHBP55084 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HADHBP55084 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HADHBP55084 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HADHBP55084 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HADHBP55084 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HADHBP55084 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HADHBP55084 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HADHBP55084 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HADHBP55084 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HADHBP55084 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HADHBP55084 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HADHBP55084 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HADHBP55084 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HADHBP55084 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HADHBP55084 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HADHBP55084 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HADHBP55084 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HADHBP55084 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HADHBP55084 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HADHBP55084 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HADHBP55084 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HADHBP55084 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HADHBP55084 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HADHBP55084 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HADHBP55084 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HADHBP55084 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HADHBP55084 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HADHBP55084 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HADHBP55084 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HADHBP55084 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
HADHBP55084 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
HADHBP55084 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HADHBP55084 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HADHBP55084 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HADHBP55084 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HADHBP55084 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HADHBP55084 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HADHBP55084 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HADHBP55084 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HADHBP55084 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HADHBP55084 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HADHBP55084 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HADHBP55084 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HADHBP55084 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HADHBP55084 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HADHBP55084 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HADHBP55084 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HADHBP55084 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HADHBP55084 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HADHBP55084 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HADHBP55084 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HADHBP55084 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HADHBP55084 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HADHBP55084 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HADHBP55084 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HADHBP55084 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HADHBP55084 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HADHBP55084 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HADHBP55084 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
HADHBP55084 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HADHBP55084 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HADHBP55084 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HADHBP55084 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HADHBP55084 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HADHBP55084 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HADHBP55084 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HADHBP55084 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HADHBP55084 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HADHBP55084 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HADHBP55084 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
HADHBP55084 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HADHBP55084 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
HADHBP55084 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HADHBP55084 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HADHBP55084 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HADHBP55084 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HADHBP55084 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HADHBP55084 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HADHBP55084 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HADHBP55084 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HADHBP55084 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HADHBP55084 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HADHBP55084 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HADHBP55084 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HADHBP55084 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HADHBP55084 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HADHBP55084 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms