Protein–RNA interactions for Protein: P55055

NR1H2, Oxysterols receptor LXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H2P55055 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NR1H2P55055 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR1H2P55055 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NR1H2P55055 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR1H2P55055 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR1H2P55055 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR1H2P55055 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR1H2P55055 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR1H2P55055 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NR1H2P55055 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR1H2P55055 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR1H2P55055 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR1H2P55055 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR1H2P55055 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR1H2P55055 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1H2P55055 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1H2P55055 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1H2P55055 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1H2P55055 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR1H2P55055 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR1H2P55055 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR1H2P55055 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR1H2P55055 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR1H2P55055 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR1H2P55055 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR1H2P55055 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR1H2P55055 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR1H2P55055 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR1H2P55055 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR1H2P55055 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1H2P55055 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1H2P55055 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR1H2P55055 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR1H2P55055 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR1H2P55055 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR1H2P55055 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NR1H2P55055 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NR1H2P55055 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR1H2P55055 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR1H2P55055 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR1H2P55055 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR1H2P55055 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR1H2P55055 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR1H2P55055 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR1H2P55055 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR1H2P55055 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR1H2P55055 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR1H2P55055 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR1H2P55055 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR1H2P55055 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR1H2P55055 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR1H2P55055 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR1H2P55055 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR1H2P55055 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NR1H2P55055 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR1H2P55055 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NR1H2P55055 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR1H2P55055 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR1H2P55055 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR1H2P55055 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR1H2P55055 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR1H2P55055 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR1H2P55055 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR1H2P55055 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR1H2P55055 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR1H2P55055 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR1H2P55055 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR1H2P55055 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR1H2P55055 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR1H2P55055 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR1H2P55055 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR1H2P55055 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR1H2P55055 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR1H2P55055 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR1H2P55055 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR1H2P55055 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR1H2P55055 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR1H2P55055 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR1H2P55055 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR1H2P55055 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR1H2P55055 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR1H2P55055 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR1H2P55055 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR1H2P55055 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR1H2P55055 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR1H2P55055 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NR1H2P55055 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR1H2P55055 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR1H2P55055 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR1H2P55055 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR1H2P55055 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NR1H2P55055 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR1H2P55055 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR1H2P55055 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR1H2P55055 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR1H2P55055 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR1H2P55055 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR1H2P55055 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR1H2P55055 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR1H2P55055 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms