Protein–RNA interactions for Protein: P52926

HMGA2, High mobility group protein HMGI-C, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA2P52926 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGA2P52926 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGA2P52926 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGA2P52926 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGA2P52926 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGA2P52926 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGA2P52926 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGA2P52926 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGA2P52926 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGA2P52926 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGA2P52926 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGA2P52926 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGA2P52926 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGA2P52926 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGA2P52926 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGA2P52926 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGA2P52926 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGA2P52926 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGA2P52926 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGA2P52926 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGA2P52926 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGA2P52926 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGA2P52926 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGA2P52926 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGA2P52926 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGA2P52926 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGA2P52926 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGA2P52926 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGA2P52926 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGA2P52926 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGA2P52926 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGA2P52926 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGA2P52926 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGA2P52926 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HMGA2P52926 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HMGA2P52926 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGA2P52926 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGA2P52926 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HMGA2P52926 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HMGA2P52926 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGA2P52926 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGA2P52926 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGA2P52926 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HMGA2P52926 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HMGA2P52926 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGA2P52926 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HMGA2P52926 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGA2P52926 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HMGA2P52926 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGA2P52926 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGA2P52926 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGA2P52926 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGA2P52926 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGA2P52926 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGA2P52926 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HMGA2P52926 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGA2P52926 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HMGA2P52926 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HMGA2P52926 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGA2P52926 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HMGA2P52926 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGA2P52926 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HMGA2P52926 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGA2P52926 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HMGA2P52926 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGA2P52926 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGA2P52926 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGA2P52926 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HMGA2P52926 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGA2P52926 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGA2P52926 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGA2P52926 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGA2P52926 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HMGA2P52926 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGA2P52926 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGA2P52926 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGA2P52926 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGA2P52926 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HMGA2P52926 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGA2P52926 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HMGA2P52926 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HMGA2P52926 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGA2P52926 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HMGA2P52926 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGA2P52926 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGA2P52926 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HMGA2P52926 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGA2P52926 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGA2P52926 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGA2P52926 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HMGA2P52926 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGA2P52926 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGA2P52926 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGA2P52926 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGA2P52926 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMGA2P52926 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMGA2P52926 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGA2P52926 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGA2P52926 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMGA2P52926 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms