Protein–RNA interactions for Protein: P52849

NDST2, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST2P52849 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NDST2P52849 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NDST2P52849 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NDST2P52849 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NDST2P52849 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NDST2P52849 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NDST2P52849 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NDST2P52849 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NDST2P52849 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NDST2P52849 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NDST2P52849 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NDST2P52849 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NDST2P52849 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NDST2P52849 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NDST2P52849 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NDST2P52849 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NDST2P52849 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NDST2P52849 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NDST2P52849 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NDST2P52849 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NDST2P52849 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NDST2P52849 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NDST2P52849 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NDST2P52849 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NDST2P52849 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NDST2P52849 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NDST2P52849 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NDST2P52849 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NDST2P52849 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NDST2P52849 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NDST2P52849 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NDST2P52849 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NDST2P52849 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NDST2P52849 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NDST2P52849 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NDST2P52849 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NDST2P52849 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NDST2P52849 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NDST2P52849 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NDST2P52849 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NDST2P52849 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NDST2P52849 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NDST2P52849 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NDST2P52849 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NDST2P52849 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NDST2P52849 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NDST2P52849 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NDST2P52849 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NDST2P52849 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NDST2P52849 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NDST2P52849 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NDST2P52849 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NDST2P52849 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NDST2P52849 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NDST2P52849 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NDST2P52849 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NDST2P52849 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NDST2P52849 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NDST2P52849 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NDST2P52849 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NDST2P52849 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NDST2P52849 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NDST2P52849 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NDST2P52849 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NDST2P52849 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NDST2P52849 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NDST2P52849 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NDST2P52849 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NDST2P52849 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NDST2P52849 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NDST2P52849 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NDST2P52849 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NDST2P52849 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NDST2P52849 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NDST2P52849 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NDST2P52849 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NDST2P52849 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NDST2P52849 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NDST2P52849 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NDST2P52849 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NDST2P52849 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NDST2P52849 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NDST2P52849 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NDST2P52849 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NDST2P52849 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NDST2P52849 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NDST2P52849 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NDST2P52849 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NDST2P52849 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NDST2P52849 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NDST2P52849 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NDST2P52849 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NDST2P52849 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NDST2P52849 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NDST2P52849 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NDST2P52849 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NDST2P52849 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NDST2P52849 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NDST2P52849 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NDST2P52849 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms