Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LUMP51884 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LUMP51884 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LUMP51884 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LUMP51884 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LUMP51884 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LUMP51884 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LUMP51884 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LUMP51884 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LUMP51884 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LUMP51884 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LUMP51884 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LUMP51884 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LUMP51884 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LUMP51884 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LUMP51884 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LUMP51884 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LUMP51884 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LUMP51884 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LUMP51884 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LUMP51884 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LUMP51884 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LUMP51884 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LUMP51884 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LUMP51884 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LUMP51884 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LUMP51884 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LUMP51884 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LUMP51884 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LUMP51884 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LUMP51884 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LUMP51884 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LUMP51884 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LUMP51884 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LUMP51884 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LUMP51884 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LUMP51884 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LUMP51884 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LUMP51884 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LUMP51884 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LUMP51884 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LUMP51884 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LUMP51884 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LUMP51884 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LUMP51884 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LUMP51884 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LUMP51884 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LUMP51884 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LUMP51884 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LUMP51884 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LUMP51884 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LUMP51884 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LUMP51884 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LUMP51884 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LUMP51884 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LUMP51884 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LUMP51884 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LUMP51884 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LUMP51884 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LUMP51884 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LUMP51884 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LUMP51884 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LUMP51884 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LUMP51884 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LUMP51884 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LUMP51884 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LUMP51884 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LUMP51884 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LUMP51884 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LUMP51884 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LUMP51884 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LUMP51884 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LUMP51884 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LUMP51884 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LUMP51884 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LUMP51884 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LUMP51884 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LUMP51884 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LUMP51884 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LUMP51884 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LUMP51884 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LUMP51884 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LUMP51884 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LUMP51884 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LUMP51884 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LUMP51884 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LUMP51884 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LUMP51884 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LUMP51884 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LUMP51884 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LUMP51884 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LUMP51884 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LUMP51884 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LUMP51884 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LUMP51884 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LUMP51884 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LUMP51884 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LUMP51884 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LUMP51884 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LUMP51884 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms