Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLCN3P51790 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CLCN3P51790 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLCN3P51790 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLCN3P51790 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLCN3P51790 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLCN3P51790 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLCN3P51790 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLCN3P51790 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLCN3P51790 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLCN3P51790 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CLCN3P51790 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLCN3P51790 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CLCN3P51790 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLCN3P51790 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLCN3P51790 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLCN3P51790 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLCN3P51790 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLCN3P51790 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLCN3P51790 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLCN3P51790 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLCN3P51790 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLCN3P51790 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLCN3P51790 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLCN3P51790 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLCN3P51790 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLCN3P51790 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLCN3P51790 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLCN3P51790 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLCN3P51790 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CLCN3P51790 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLCN3P51790 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CLCN3P51790 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CLCN3P51790 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CLCN3P51790 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLCN3P51790 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CLCN3P51790 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLCN3P51790 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CLCN3P51790 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLCN3P51790 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLCN3P51790 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLCN3P51790 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CLCN3P51790 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLCN3P51790 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLCN3P51790 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLCN3P51790 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CLCN3P51790 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CLCN3P51790 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLCN3P51790 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLCN3P51790 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLCN3P51790 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLCN3P51790 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLCN3P51790 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLCN3P51790 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLCN3P51790 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLCN3P51790 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CLCN3P51790 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLCN3P51790 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLCN3P51790 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CLCN3P51790 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLCN3P51790 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLCN3P51790 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLCN3P51790 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CLCN3P51790 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLCN3P51790 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLCN3P51790 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLCN3P51790 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLCN3P51790 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLCN3P51790 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLCN3P51790 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLCN3P51790 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLCN3P51790 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLCN3P51790 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLCN3P51790 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLCN3P51790 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLCN3P51790 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLCN3P51790 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLCN3P51790 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLCN3P51790 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLCN3P51790 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLCN3P51790 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLCN3P51790 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLCN3P51790 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLCN3P51790 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CLCN3P51790 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLCN3P51790 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLCN3P51790 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLCN3P51790 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLCN3P51790 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLCN3P51790 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLCN3P51790 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLCN3P51790 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLCN3P51790 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLCN3P51790 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLCN3P51790 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLCN3P51790 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLCN3P51790 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLCN3P51790 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLCN3P51790 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLCN3P51790 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms