Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PEX5P50542 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PEX5P50542 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PEX5P50542 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PEX5P50542 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PEX5P50542 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PEX5P50542 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PEX5P50542 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PEX5P50542 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PEX5P50542 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PEX5P50542 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PEX5P50542 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PEX5P50542 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PEX5P50542 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PEX5P50542 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PEX5P50542 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PEX5P50542 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PEX5P50542 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PEX5P50542 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PEX5P50542 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PEX5P50542 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PEX5P50542 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PEX5P50542 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PEX5P50542 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PEX5P50542 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PEX5P50542 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PEX5P50542 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PEX5P50542 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PEX5P50542 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PEX5P50542 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PEX5P50542 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PEX5P50542 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PEX5P50542 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PEX5P50542 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PEX5P50542 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PEX5P50542 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PEX5P50542 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PEX5P50542 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PEX5P50542 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PEX5P50542 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PEX5P50542 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PEX5P50542 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PEX5P50542 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PEX5P50542 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PEX5P50542 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PEX5P50542 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PEX5P50542 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PEX5P50542 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PEX5P50542 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PEX5P50542 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PEX5P50542 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PEX5P50542 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PEX5P50542 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PEX5P50542 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PEX5P50542 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PEX5P50542 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PEX5P50542 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PEX5P50542 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PEX5P50542 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PEX5P50542 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PEX5P50542 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PEX5P50542 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PEX5P50542 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PEX5P50542 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PEX5P50542 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PEX5P50542 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PEX5P50542 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PEX5P50542 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PEX5P50542 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PEX5P50542 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PEX5P50542 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PEX5P50542 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PEX5P50542 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PEX5P50542 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PEX5P50542 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PEX5P50542 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PEX5P50542 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PEX5P50542 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PEX5P50542 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PEX5P50542 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PEX5P50542 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PEX5P50542 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PEX5P50542 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PEX5P50542 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PEX5P50542 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PEX5P50542 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PEX5P50542 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PEX5P50542 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PEX5P50542 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PEX5P50542 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PEX5P50542 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PEX5P50542 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PEX5P50542 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PEX5P50542 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PEX5P50542 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PEX5P50542 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PEX5P50542 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PEX5P50542 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PEX5P50542 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PEX5P50542 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms