Protein–RNA interactions for Protein: P50336

PPOX, Protoporphyrinogen oxidase, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPOXP50336 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPOXP50336 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPOXP50336 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPOXP50336 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPOXP50336 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPOXP50336 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPOXP50336 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPOXP50336 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPOXP50336 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPOXP50336 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPOXP50336 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPOXP50336 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPOXP50336 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPOXP50336 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPOXP50336 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPOXP50336 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPOXP50336 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPOXP50336 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPOXP50336 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPOXP50336 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPOXP50336 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPOXP50336 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPOXP50336 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPOXP50336 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPOXP50336 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PPOXP50336 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPOXP50336 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPOXP50336 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPOXP50336 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPOXP50336 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPOXP50336 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPOXP50336 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PPOXP50336 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PPOXP50336 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPOXP50336 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPOXP50336 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPOXP50336 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PPOXP50336 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPOXP50336 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPOXP50336 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPOXP50336 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPOXP50336 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPOXP50336 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPOXP50336 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPOXP50336 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPOXP50336 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPOXP50336 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPOXP50336 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PPOXP50336 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPOXP50336 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPOXP50336 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPOXP50336 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PPOXP50336 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPOXP50336 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPOXP50336 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPOXP50336 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPOXP50336 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPOXP50336 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPOXP50336 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPOXP50336 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPOXP50336 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPOXP50336 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPOXP50336 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PPOXP50336 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPOXP50336 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPOXP50336 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPOXP50336 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPOXP50336 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPOXP50336 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPOXP50336 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPOXP50336 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPOXP50336 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPOXP50336 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPOXP50336 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PPOXP50336 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPOXP50336 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPOXP50336 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPOXP50336 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPOXP50336 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPOXP50336 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPOXP50336 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPOXP50336 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPOXP50336 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPOXP50336 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPOXP50336 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPOXP50336 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPOXP50336 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPOXP50336 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPOXP50336 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPOXP50336 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPOXP50336 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPOXP50336 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPOXP50336 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PPOXP50336 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PPOXP50336 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPOXP50336 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPOXP50336 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPOXP50336 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPOXP50336 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPOXP50336 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms