Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GSK3BP49841 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GSK3BP49841 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GSK3BP49841 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSK3BP49841 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSK3BP49841 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GSK3BP49841 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GSK3BP49841 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GSK3BP49841 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GSK3BP49841 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GSK3BP49841 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GSK3BP49841 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GSK3BP49841 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GSK3BP49841 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSK3BP49841 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSK3BP49841 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSK3BP49841 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GSK3BP49841 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GSK3BP49841 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GSK3BP49841 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GSK3BP49841 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GSK3BP49841 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSK3BP49841 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSK3BP49841 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSK3BP49841 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSK3BP49841 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GSK3BP49841 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSK3BP49841 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSK3BP49841 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSK3BP49841 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSK3BP49841 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSK3BP49841 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSK3BP49841 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GSK3BP49841 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GSK3BP49841 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GSK3BP49841 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GSK3BP49841 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GSK3BP49841 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GSK3BP49841 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GSK3BP49841 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GSK3BP49841 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GSK3BP49841 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GSK3BP49841 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GSK3BP49841 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GSK3BP49841 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GSK3BP49841 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GSK3BP49841 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GSK3BP49841 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GSK3BP49841 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSK3BP49841 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSK3BP49841 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSK3BP49841 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSK3BP49841 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GSK3BP49841 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GSK3BP49841 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GSK3BP49841 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GSK3BP49841 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSK3BP49841 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GSK3BP49841 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GSK3BP49841 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSK3BP49841 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSK3BP49841 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSK3BP49841 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GSK3BP49841 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GSK3BP49841 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GSK3BP49841 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GSK3BP49841 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GSK3BP49841 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GSK3BP49841 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GSK3BP49841 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GSK3BP49841 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GSK3BP49841 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GSK3BP49841 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GSK3BP49841 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GSK3BP49841 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GSK3BP49841 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GSK3BP49841 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GSK3BP49841 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GSK3BP49841 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GSK3BP49841 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GSK3BP49841 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GSK3BP49841 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GSK3BP49841 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GSK3BP49841 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GSK3BP49841 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GSK3BP49841 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GSK3BP49841 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GSK3BP49841 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GSK3BP49841 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GSK3BP49841 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GSK3BP49841 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GSK3BP49841 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GSK3BP49841 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GSK3BP49841 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GSK3BP49841 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GSK3BP49841 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GSK3BP49841 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GSK3BP49841 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GSK3BP49841 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GSK3BP49841 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms