Protein–RNA interactions for Protein: P49746

THBS3, Thrombospondin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3P49746 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
THBS3P49746 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
THBS3P49746 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
THBS3P49746 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
THBS3P49746 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
THBS3P49746 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
THBS3P49746 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
THBS3P49746 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
THBS3P49746 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
THBS3P49746 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
THBS3P49746 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
THBS3P49746 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
THBS3P49746 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
THBS3P49746 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
THBS3P49746 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
THBS3P49746 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
THBS3P49746 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
THBS3P49746 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
THBS3P49746 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
THBS3P49746 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
THBS3P49746 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
THBS3P49746 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
THBS3P49746 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
THBS3P49746 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
THBS3P49746 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
THBS3P49746 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
THBS3P49746 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
THBS3P49746 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
THBS3P49746 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
THBS3P49746 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
THBS3P49746 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
THBS3P49746 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
THBS3P49746 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
THBS3P49746 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
THBS3P49746 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
THBS3P49746 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
THBS3P49746 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
THBS3P49746 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
THBS3P49746 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
THBS3P49746 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
THBS3P49746 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
THBS3P49746 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
THBS3P49746 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
THBS3P49746 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
THBS3P49746 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
THBS3P49746 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
THBS3P49746 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
THBS3P49746 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
THBS3P49746 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
THBS3P49746 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
THBS3P49746 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
THBS3P49746 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
THBS3P49746 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
THBS3P49746 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
THBS3P49746 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
THBS3P49746 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
THBS3P49746 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
THBS3P49746 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
THBS3P49746 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
THBS3P49746 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
THBS3P49746 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
THBS3P49746 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
THBS3P49746 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
THBS3P49746 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
THBS3P49746 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
THBS3P49746 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
THBS3P49746 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
THBS3P49746 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
THBS3P49746 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
THBS3P49746 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
THBS3P49746 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
THBS3P49746 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
THBS3P49746 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
THBS3P49746 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
THBS3P49746 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
THBS3P49746 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
THBS3P49746 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
THBS3P49746 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
THBS3P49746 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
THBS3P49746 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
THBS3P49746 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
THBS3P49746 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
THBS3P49746 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
THBS3P49746 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
THBS3P49746 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
THBS3P49746 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
THBS3P49746 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
THBS3P49746 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
THBS3P49746 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
THBS3P49746 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
THBS3P49746 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
THBS3P49746 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
THBS3P49746 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
THBS3P49746 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
THBS3P49746 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
THBS3P49746 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
THBS3P49746 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
THBS3P49746 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
THBS3P49746 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
THBS3P49746 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms