Protein–RNA interactions for Protein: P49720

PSMB3, Proteasome subunit beta type-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB3P49720 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB3P49720 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB3P49720 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMB3P49720 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMB3P49720 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMB3P49720 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB3P49720 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB3P49720 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB3P49720 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMB3P49720 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMB3P49720 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB3P49720 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB3P49720 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB3P49720 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB3P49720 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMB3P49720 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB3P49720 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB3P49720 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB3P49720 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB3P49720 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMB3P49720 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMB3P49720 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB3P49720 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB3P49720 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB3P49720 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB3P49720 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMB3P49720 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PSMB3P49720 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PSMB3P49720 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB3P49720 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB3P49720 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB3P49720 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB3P49720 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PSMB3P49720 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB3P49720 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB3P49720 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB3P49720 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PSMB3P49720 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB3P49720 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PSMB3P49720 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSMB3P49720 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB3P49720 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB3P49720 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB3P49720 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSMB3P49720 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB3P49720 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB3P49720 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB3P49720 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB3P49720 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB3P49720 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB3P49720 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSMB3P49720 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB3P49720 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB3P49720 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSMB3P49720 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB3P49720 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB3P49720 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB3P49720 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB3P49720 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB3P49720 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSMB3P49720 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB3P49720 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB3P49720 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB3P49720 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB3P49720 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB3P49720 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB3P49720 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB3P49720 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB3P49720 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB3P49720 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB3P49720 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB3P49720 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB3P49720 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB3P49720 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB3P49720 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB3P49720 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB3P49720 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB3P49720 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB3P49720 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB3P49720 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB3P49720 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB3P49720 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB3P49720 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB3P49720 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB3P49720 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB3P49720 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PSMB3P49720 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB3P49720 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB3P49720 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PSMB3P49720 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PSMB3P49720 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB3P49720 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB3P49720 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB3P49720 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB3P49720 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB3P49720 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMB3P49720 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMB3P49720 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB3P49720 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB3P49720 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms