Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FNTAP49354 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FNTAP49354 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FNTAP49354 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FNTAP49354 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FNTAP49354 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FNTAP49354 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FNTAP49354 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FNTAP49354 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
FNTAP49354 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FNTAP49354 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FNTAP49354 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FNTAP49354 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FNTAP49354 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FNTAP49354 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FNTAP49354 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FNTAP49354 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FNTAP49354 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FNTAP49354 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FNTAP49354 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FNTAP49354 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FNTAP49354 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FNTAP49354 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FNTAP49354 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FNTAP49354 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FNTAP49354 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FNTAP49354 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FNTAP49354 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FNTAP49354 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FNTAP49354 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FNTAP49354 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FNTAP49354 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FNTAP49354 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FNTAP49354 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FNTAP49354 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FNTAP49354 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FNTAP49354 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FNTAP49354 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FNTAP49354 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FNTAP49354 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FNTAP49354 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FNTAP49354 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FNTAP49354 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FNTAP49354 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FNTAP49354 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FNTAP49354 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FNTAP49354 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FNTAP49354 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FNTAP49354 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FNTAP49354 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FNTAP49354 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FNTAP49354 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FNTAP49354 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FNTAP49354 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FNTAP49354 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FNTAP49354 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FNTAP49354 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FNTAP49354 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FNTAP49354 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FNTAP49354 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FNTAP49354 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FNTAP49354 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FNTAP49354 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FNTAP49354 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FNTAP49354 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FNTAP49354 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FNTAP49354 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FNTAP49354 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FNTAP49354 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FNTAP49354 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FNTAP49354 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FNTAP49354 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FNTAP49354 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FNTAP49354 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FNTAP49354 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FNTAP49354 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FNTAP49354 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FNTAP49354 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FNTAP49354 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FNTAP49354 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FNTAP49354 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FNTAP49354 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FNTAP49354 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FNTAP49354 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FNTAP49354 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FNTAP49354 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FNTAP49354 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FNTAP49354 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
FNTAP49354 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FNTAP49354 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FNTAP49354 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FNTAP49354 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FNTAP49354 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FNTAP49354 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FNTAP49354 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FNTAP49354 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
FNTAP49354 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FNTAP49354 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FNTAP49354 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FNTAP49354 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms