Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A9P48067 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A9P48067 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC6A9P48067 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A9P48067 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A9P48067 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC6A9P48067 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC6A9P48067 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A9P48067 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A9P48067 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A9P48067 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC6A9P48067 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A9P48067 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A9P48067 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC6A9P48067 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A9P48067 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A9P48067 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC6A9P48067 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC6A9P48067 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A9P48067 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A9P48067 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC6A9P48067 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A9P48067 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A9P48067 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC6A9P48067 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A9P48067 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A9P48067 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A9P48067 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC6A9P48067 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC6A9P48067 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC6A9P48067 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SLC6A9P48067 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A9P48067 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A9P48067 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A9P48067 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A9P48067 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC6A9P48067 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A9P48067 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A9P48067 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC6A9P48067 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC6A9P48067 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC6A9P48067 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A9P48067 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A9P48067 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A9P48067 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A9P48067 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A9P48067 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A9P48067 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC6A9P48067 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC6A9P48067 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC6A9P48067 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC6A9P48067 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC6A9P48067 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC6A9P48067 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC6A9P48067 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC6A9P48067 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC6A9P48067 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC6A9P48067 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC6A9P48067 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC6A9P48067 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC6A9P48067 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC6A9P48067 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC6A9P48067 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC6A9P48067 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC6A9P48067 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A9P48067 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC6A9P48067 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A9P48067 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A9P48067 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC6A9P48067 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A9P48067 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A9P48067 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC6A9P48067 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A9P48067 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC6A9P48067 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A9P48067 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A9P48067 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A9P48067 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC6A9P48067 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A9P48067 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A9P48067 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A9P48067 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A9P48067 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC6A9P48067 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC6A9P48067 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A9P48067 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC6A9P48067 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A9P48067 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A9P48067 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A9P48067 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A9P48067 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A9P48067 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC6A9P48067 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A9P48067 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A9P48067 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC6A9P48067 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC6A9P48067 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC6A9P48067 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A9P48067 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC6A9P48067 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms