Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRATP43155 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRATP43155 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRATP43155 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRATP43155 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CRATP43155 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRATP43155 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRATP43155 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRATP43155 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRATP43155 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRATP43155 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRATP43155 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRATP43155 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRATP43155 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRATP43155 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRATP43155 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRATP43155 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRATP43155 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRATP43155 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRATP43155 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRATP43155 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRATP43155 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRATP43155 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CRATP43155 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRATP43155 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRATP43155 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRATP43155 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRATP43155 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CRATP43155 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRATP43155 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRATP43155 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRATP43155 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRATP43155 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRATP43155 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRATP43155 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CRATP43155 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRATP43155 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRATP43155 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRATP43155 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRATP43155 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRATP43155 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRATP43155 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRATP43155 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CRATP43155 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRATP43155 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRATP43155 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRATP43155 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRATP43155 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRATP43155 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRATP43155 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRATP43155 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRATP43155 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRATP43155 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRATP43155 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRATP43155 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRATP43155 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRATP43155 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRATP43155 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRATP43155 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRATP43155 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRATP43155 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRATP43155 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRATP43155 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRATP43155 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRATP43155 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRATP43155 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRATP43155 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRATP43155 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRATP43155 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRATP43155 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRATP43155 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRATP43155 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRATP43155 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRATP43155 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRATP43155 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRATP43155 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRATP43155 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRATP43155 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRATP43155 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRATP43155 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRATP43155 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRATP43155 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRATP43155 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CRATP43155 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRATP43155 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRATP43155 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRATP43155 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRATP43155 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRATP43155 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRATP43155 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRATP43155 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRATP43155 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRATP43155 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRATP43155 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRATP43155 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRATP43155 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRATP43155 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRATP43155 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRATP43155 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRATP43155 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.4 ms