Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC1A2P43004 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC1A2P43004 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC1A2P43004 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC1A2P43004 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC1A2P43004 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC1A2P43004 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC1A2P43004 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC1A2P43004 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC1A2P43004 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC1A2P43004 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC1A2P43004 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC1A2P43004 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC1A2P43004 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC1A2P43004 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC1A2P43004 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC1A2P43004 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC1A2P43004 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC1A2P43004 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC1A2P43004 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC1A2P43004 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC1A2P43004 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC1A2P43004 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC1A2P43004 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC1A2P43004 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC1A2P43004 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC1A2P43004 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC1A2P43004 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC1A2P43004 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC1A2P43004 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC1A2P43004 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC1A2P43004 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC1A2P43004 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC1A2P43004 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
SLC1A2P43004 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC1A2P43004 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC1A2P43004 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC1A2P43004 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC1A2P43004 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC1A2P43004 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC1A2P43004 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC1A2P43004 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC1A2P43004 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC1A2P43004 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC1A2P43004 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC1A2P43004 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC1A2P43004 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC1A2P43004 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC1A2P43004 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC1A2P43004 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC1A2P43004 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC1A2P43004 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC1A2P43004 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC1A2P43004 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC1A2P43004 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC1A2P43004 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC1A2P43004 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC1A2P43004 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC1A2P43004 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC1A2P43004 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC1A2P43004 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC1A2P43004 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC1A2P43004 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC1A2P43004 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC1A2P43004 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC1A2P43004 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC1A2P43004 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC1A2P43004 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC1A2P43004 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC1A2P43004 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC1A2P43004 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC1A2P43004 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC1A2P43004 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC1A2P43004 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC1A2P43004 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC1A2P43004 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC1A2P43004 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC1A2P43004 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC1A2P43004 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC1A2P43004 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC1A2P43004 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC1A2P43004 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC1A2P43004 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC1A2P43004 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC1A2P43004 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC1A2P43004 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC1A2P43004 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC1A2P43004 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC1A2P43004 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC1A2P43004 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC1A2P43004 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC1A2P43004 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC1A2P43004 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC1A2P43004 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC1A2P43004 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC1A2P43004 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC1A2P43004 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC1A2P43004 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC1A2P43004 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC1A2P43004 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms