Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL35P42766 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL35P42766 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL35P42766 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL35P42766 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL35P42766 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL35P42766 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL35P42766 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL35P42766 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL35P42766 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL35P42766 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL35P42766 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL35P42766 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL35P42766 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RPL35P42766 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RPL35P42766 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
RPL35P42766 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL35P42766 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL35P42766 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL35P42766 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPL35P42766 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL35P42766 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL35P42766 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL35P42766 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL35P42766 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL35P42766 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPL35P42766 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL35P42766 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL35P42766 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL35P42766 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL35P42766 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL35P42766 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL35P42766 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL35P42766 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL35P42766 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL35P42766 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL35P42766 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL35P42766 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL35P42766 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL35P42766 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL35P42766 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL35P42766 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL35P42766 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL35P42766 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL35P42766 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL35P42766 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL35P42766 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL35P42766 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL35P42766 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL35P42766 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL35P42766 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL35P42766 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL35P42766 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL35P42766 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL35P42766 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL35P42766 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL35P42766 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL35P42766 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL35P42766 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL35P42766 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL35P42766 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL35P42766 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL35P42766 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL35P42766 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL35P42766 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL35P42766 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL35P42766 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL35P42766 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPL35P42766 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL35P42766 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL35P42766 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL35P42766 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL35P42766 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL35P42766 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL35P42766 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL35P42766 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL35P42766 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL35P42766 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL35P42766 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL35P42766 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL35P42766 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL35P42766 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL35P42766 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL35P42766 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL35P42766 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL35P42766 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL35P42766 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL35P42766 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL35P42766 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL35P42766 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL35P42766 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL35P42766 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL35P42766 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL35P42766 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL35P42766 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPL35P42766 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL35P42766 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL35P42766 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL35P42766 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL35P42766 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms