Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GRIA2P42262 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GRIA2P42262 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GRIA2P42262 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GRIA2P42262 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
GRIA2P42262 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GRIA2P42262 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GRIA2P42262 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GRIA2P42262 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GRIA2P42262 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GRIA2P42262 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GRIA2P42262 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GRIA2P42262 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GRIA2P42262 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
GRIA2P42262 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GRIA2P42262 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIA2P42262 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIA2P42262 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIA2P42262 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIA2P42262 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIA2P42262 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIA2P42262 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIA2P42262 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIA2P42262 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIA2P42262 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIA2P42262 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIA2P42262 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIA2P42262 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIA2P42262 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIA2P42262 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIA2P42262 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GRIA2P42262 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRIA2P42262 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIA2P42262 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIA2P42262 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIA2P42262 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIA2P42262 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIA2P42262 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIA2P42262 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIA2P42262 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIA2P42262 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIA2P42262 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIA2P42262 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIA2P42262 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIA2P42262 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIA2P42262 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIA2P42262 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIA2P42262 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIA2P42262 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIA2P42262 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIA2P42262 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIA2P42262 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIA2P42262 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIA2P42262 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIA2P42262 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIA2P42262 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIA2P42262 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIA2P42262 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIA2P42262 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIA2P42262 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIA2P42262 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIA2P42262 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIA2P42262 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIA2P42262 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GRIA2P42262 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRIA2P42262 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRIA2P42262 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRIA2P42262 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRIA2P42262 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRIA2P42262 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIA2P42262 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIA2P42262 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIA2P42262 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIA2P42262 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIA2P42262 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIA2P42262 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIA2P42262 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIA2P42262 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIA2P42262 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIA2P42262 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIA2P42262 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIA2P42262 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIA2P42262 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIA2P42262 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIA2P42262 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIA2P42262 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIA2P42262 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIA2P42262 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIA2P42262 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GRIA2P42262 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GRIA2P42262 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GRIA2P42262 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRIA2P42262 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRIA2P42262 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIA2P42262 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIA2P42262 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRIA2P42262 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIA2P42262 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GRIA2P42262 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GRIA2P42262 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms